More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1937 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  100 
 
 		 410 aa  821    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  55.84 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.15 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.63 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.88 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.22 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.34 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.46 
 
 		 298 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.01 
 
 		 282 aa  173  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.35 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.82 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.35 
 
 		 290 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  38.13 
 
 		 340 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  42.11 
 
 		 297 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.65 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.65 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  41.87 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.44 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.5 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.09 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  42.92 
 
 		 608 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.08 
 
 		 617 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.57 
 
 		 274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.47 
 
 		 297 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.91 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.02 
 
 		 587 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.87 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  36.97 
 
 		 618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  37.15 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  32.35 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.44 
 
 		 656 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.8 
 
 		 605 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.34 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  39.41 
 
 		 616 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.24 
 
 		 616 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  39.41 
 
 		 618 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  39.41 
 
 		 618 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  39.41 
 
 		 622 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  39.41 
 
 		 618 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  39.41 
 
 		 633 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.91 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  39.41 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.41 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  38.3 
 
 		 616 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  39.41 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.11 
 
 		 637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  37.76 
 
 		 616 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.44 
 
 		 598 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.44 
 
 		 598 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.98 
 
 		 633 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  40.87 
 
 		 612 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.08 
 
 		 618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  37.7 
 
 		 617 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.21 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  38.98 
 
 		 618 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.77 
 
 		 613 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.53 
 
 		 611 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.33 
 
 		 590 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.07 
 
 		 613 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.53 
 
 		 595 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.6 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.09 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.98 
 
 		 617 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  38.99 
 
 		 610 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.09 
 
 		 595 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.09 
 
 		 613 aa  143  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.94 
 
 		 593 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.94 
 
 		 593 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  35.64 
 
 		 609 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  37.66 
 
 		 618 aa  142  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  35.83 
 
 		 616 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  35.83 
 
 		 616 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.27 
 
 		 615 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  35.83 
 
 		 616 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.48 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.74 
 
 		 614 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.29 
 
 		 595 aa  140  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.02 
 
 		 298 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  38.24 
 
 		 623 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.77 
 
 		 613 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  36.54 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.59 
 
 		 293 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 615 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 615 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  38.89 
 
 		 269 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 615 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  31.37 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.43 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  36.54 
 
 		 618 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  36.54 
 
 		 618 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.11 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  39.41 
 
 		 618 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  37.71 
 
 		 583 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.48 
 
 		 649 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.08 
 
 		 614 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  37.7 
 
 		 618 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  36.15 
 
 		 618 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38.89 
 
 		 269 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.08 
 
 		 614 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.74 
 
 		 617 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>