More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2551 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  63.05 
 
 
295 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  54.79 
 
 
301 aa  329  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  61.9 
 
 
298 aa  328  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  61.89 
 
 
260 aa  315  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  63.06 
 
 
293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  61.35 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  55.25 
 
 
298 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.4 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.32 
 
 
282 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.49 
 
 
366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  44.57 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.46 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 
296 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  46.12 
 
 
316 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.89 
 
 
382 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.89 
 
 
382 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.8 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.55 
 
 
274 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.07 
 
 
296 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.79 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.36 
 
 
299 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.76 
 
 
313 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  38.36 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.18 
 
 
272 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.81 
 
 
272 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.11 
 
 
270 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.93 
 
 
274 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.91 
 
 
383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.84 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  42.44 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  46.52 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  42.66 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.29 
 
 
324 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.65 
 
 
348 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  42.99 
 
 
272 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.79 
 
 
335 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.92 
 
 
270 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.65 
 
 
342 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  47.34 
 
 
269 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.68 
 
 
336 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  46.81 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  42.72 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  46.28 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  40.83 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  45.7 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.7 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  46.28 
 
 
269 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  46.49 
 
 
273 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 
371 aa  159  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  43.88 
 
 
340 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.4 
 
 
269 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.81 
 
 
313 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.17 
 
 
327 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.92 
 
 
326 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.68 
 
 
605 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.59 
 
 
656 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.5 
 
 
290 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.8 
 
 
282 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  37.79 
 
 
608 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  32.62 
 
 
297 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.01 
 
 
611 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39 
 
 
613 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.78 
 
 
291 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  36.76 
 
 
394 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.36 
 
 
617 aa  142  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.3 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.91 
 
 
615 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.89 
 
 
319 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.67 
 
 
605 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.67 
 
 
605 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.45 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.81 
 
 
613 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.78 
 
 
595 aa  139  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.66 
 
 
329 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.09 
 
 
615 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  40.38 
 
 
623 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.05 
 
 
595 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.81 
 
 
649 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.09 
 
 
615 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.09 
 
 
615 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.09 
 
 
615 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.82 
 
 
613 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.77 
 
 
316 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
287 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.42 
 
 
323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.92 
 
 
335 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.31 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  32.16 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  34.87 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.48 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.07 
 
 
637 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  42.44 
 
 
609 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.19 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.64 
 
 
614 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.78 
 
 
566 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.27 
 
 
613 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  37.16 
 
 
612 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.14 
 
 
617 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>