More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0508 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  100 
 
 
280 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  58.02 
 
 
297 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  56.65 
 
 
296 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  51.28 
 
 
298 aa  234  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.09 
 
 
296 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.92 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  45.59 
 
 
301 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.57 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.98 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.36 
 
 
298 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  46.22 
 
 
316 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.41 
 
 
382 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.41 
 
 
382 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.82 
 
 
299 aa  188  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.8 
 
 
290 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.08 
 
 
383 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.83 
 
 
296 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.21 
 
 
313 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.31 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.93 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.7 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.02 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  44.89 
 
 
340 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.5 
 
 
274 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.8 
 
 
282 aa  168  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.58 
 
 
313 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  34.6 
 
 
303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.06 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.62 
 
 
335 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.13 
 
 
339 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.51 
 
 
327 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  46.55 
 
 
269 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  46.86 
 
 
270 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.49 
 
 
287 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.55 
 
 
286 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.91 
 
 
269 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  42.51 
 
 
269 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42.51 
 
 
269 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.96 
 
 
269 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  39.6 
 
 
297 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  41.94 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  36.07 
 
 
322 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42.54 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.38 
 
 
371 aa  145  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.81 
 
 
287 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.35 
 
 
272 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.35 
 
 
272 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.95 
 
 
326 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.06 
 
 
348 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44 
 
 
274 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 
605 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  40.57 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  41.85 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.06 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  45.45 
 
 
273 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.71 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  45.24 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.33 
 
 
342 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  38.43 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  36.84 
 
 
289 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.14 
 
 
326 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.24 
 
 
605 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.24 
 
 
605 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  37.15 
 
 
410 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  34.15 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  36.77 
 
 
608 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  36.36 
 
 
609 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.53 
 
 
656 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.1 
 
 
326 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.38 
 
 
595 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  37.14 
 
 
326 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.94 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.62 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.63 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.14 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.01 
 
 
595 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.73 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  39.67 
 
 
618 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  41.15 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  39.67 
 
 
618 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  39.67 
 
 
618 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  39.67 
 
 
622 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  41.28 
 
 
618 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.18 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.22 
 
 
618 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.21 
 
 
617 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  41.71 
 
 
394 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.2 
 
 
611 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  39.67 
 
 
618 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.67 
 
 
618 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  39.67 
 
 
618 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.5 
 
 
324 aa  128  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.15 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.2 
 
 
604 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.29 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.06 
 
 
587 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.49 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  39.13 
 
 
618 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.86 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  42.86 
 
 
320 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>