More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0423 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
339 aa  694    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  52.45 
 
 
340 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.78 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.45 
 
 
342 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.14 
 
 
336 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.49 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.49 
 
 
296 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.93 
 
 
313 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  40.74 
 
 
320 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.04 
 
 
299 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.93 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.73 
 
 
298 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.86 
 
 
299 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.17 
 
 
371 aa  188  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.79 
 
 
290 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.96 
 
 
319 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.39 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  40.29 
 
 
316 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.26 
 
 
282 aa  182  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.29 
 
 
382 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.29 
 
 
382 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  40.54 
 
 
301 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.92 
 
 
295 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
321 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.64 
 
 
260 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.84 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.21 
 
 
272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.21 
 
 
272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.96 
 
 
270 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.77 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.76 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  40.54 
 
 
297 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39 
 
 
335 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.13 
 
 
324 aa  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.59 
 
 
605 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.46 
 
 
326 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.74 
 
 
366 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.36 
 
 
290 aa  169  8e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.24 
 
 
327 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.39 
 
 
307 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  45.77 
 
 
269 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  37.84 
 
 
394 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.77 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  45.9 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  38.78 
 
 
270 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  37.83 
 
 
410 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  34.22 
 
 
303 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.01 
 
 
274 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.78 
 
 
269 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.86 
 
 
311 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.48 
 
 
617 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.91 
 
 
269 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.36 
 
 
270 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  41.85 
 
 
609 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43 
 
 
269 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.28 
 
 
296 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  39.55 
 
 
273 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  42.13 
 
 
280 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  39.55 
 
 
623 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40 
 
 
589 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.95 
 
 
629 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.38 
 
 
593 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.45 
 
 
274 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.38 
 
 
593 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  40.45 
 
 
270 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.73 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.91 
 
 
640 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  37.87 
 
 
608 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.43 
 
 
587 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  36.8 
 
 
617 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  43.52 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.03 
 
 
611 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.07 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.95 
 
 
831 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.86 
 
 
325 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.38 
 
 
595 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  38.77 
 
 
616 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.44 
 
 
296 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.61 
 
 
605 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  35.8 
 
 
616 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.61 
 
 
605 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.38 
 
 
593 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2985  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.43 
 
 
320 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000162336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.97 
 
 
382 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.37 
 
 
307 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.4 
 
 
604 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  40.87 
 
 
609 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  39.55 
 
 
273 aa  149  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 
338 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.21 
 
 
298 aa  149  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.4 
 
 
293 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.27 
 
 
649 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.55 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.05 
 
 
597 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.68 
 
 
298 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  39.63 
 
 
616 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.42 
 
 
656 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  32.97 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.68 
 
 
298 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.13 
 
 
614 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>