More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0236 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  64.78 
 
 		 297 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  56.65 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.48 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.31 
 
 		 383 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  50 
 
 		 298 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  49.58 
 
 		 316 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.01 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.79 
 
 		 382 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.79 
 
 		 382 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.43 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  43.07 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.03 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.56 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.9 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.44 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.18 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.26 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.49 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.37 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.79 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  42.86 
 
 		 272 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  49.2 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.64 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  46.43 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.2 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  48.66 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.23 
 
 		 274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.79 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  45.62 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  44.04 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  47.31 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.84 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  45.16 
 
 		 273 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.84 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.3 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  43.3 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  43.36 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.16 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  37.81 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.85 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.87 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  43.75 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  41.94 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.28 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  44.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.47 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.5 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.08 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  42.29 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  35.56 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.61 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.51 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.57 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  39.51 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.29 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  39.51 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.14 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.67 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.66 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.24 
 
 		 605 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.08 
 
 		 348 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.81 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.21 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  32.57 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.96 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.19 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.43 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.21 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.09 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.63 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  34.5 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.36 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.9 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.29 
 
 		 324 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.35 
 
 		 597 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.56 
 
 		 605 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.56 
 
 		 605 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  36.92 
 
 		 608 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.76 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  37.56 
 
 		 601 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.84 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.74 
 
 		 626 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.68 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.22 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.62 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.07 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.07 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.42 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.56 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  36.79 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.07 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.32 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.89 
 
 		 615 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  37.07 
 
 		 289 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.82 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.24 
 
 		 656 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.32 
 
 		 595 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>