More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1590 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
307 aa  617  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0322  signal peptide peptidase SppA, 36K type  89.58 
 
 
307 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491128  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  88.27 
 
 
307 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  61.89 
 
 
311 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  56.77 
 
 
290 aa  309  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.73 
 
 
296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.5 
 
 
339 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  41.26 
 
 
297 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.94 
 
 
336 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.63 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.41 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.2 
 
 
313 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.27 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  35.15 
 
 
340 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.78 
 
 
307 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.33 
 
 
371 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.89 
 
 
335 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.21 
 
 
296 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.62 
 
 
348 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.47 
 
 
342 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.41 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  34.9 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.4 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.73 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.21 
 
 
293 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.19 
 
 
587 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  36 
 
 
269 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.21 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  32.62 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.57 
 
 
366 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.76 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.76 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.67 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.35 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.19 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.78 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.02 
 
 
296 aa  132  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.51 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.32 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.33 
 
 
270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.32 
 
 
282 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  35.56 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  32.03 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.93 
 
 
383 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  40 
 
 
303 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.04 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.17 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.9 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.96 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.03 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.89 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.53 
 
 
298 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  29.92 
 
 
322 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.2 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.66 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.71 
 
 
321 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.5 
 
 
605 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  31.86 
 
 
280 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.76 
 
 
311 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.11 
 
 
376 aa  125  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.13 
 
 
298 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  35.2 
 
 
608 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.2 
 
 
269 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 
335 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 
597 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  32.2 
 
 
289 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.73 
 
 
298 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.9 
 
 
831 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  34.85 
 
 
288 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.8 
 
 
334 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.67 
 
 
316 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 
287 aa  122  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
323 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  33.33 
 
 
269 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.33 
 
 
269 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.04 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.8 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  30.34 
 
 
611 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.78 
 
 
316 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  38.38 
 
 
583 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.98 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.99 
 
 
598 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.9 
 
 
351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.99 
 
 
598 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.78 
 
 
323 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  32.07 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.2 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.08 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.11 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.47 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.9 
 
 
605 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.9 
 
 
605 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.08 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.53 
 
 
595 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.11 
 
 
321 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.98 
 
 
382 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.56 
 
 
329 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.11 
 
 
321 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.07 
 
 
656 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.59 
 
 
617 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>