More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2159 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
338 aa  691    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.33 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.73 
 
 
342 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.63 
 
 
335 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.69 
 
 
336 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.55 
 
 
274 aa  160  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  36.55 
 
 
340 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.31 
 
 
282 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.86 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.08 
 
 
299 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.26 
 
 
323 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.54 
 
 
296 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.28 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.49 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.75 
 
 
371 aa  145  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.32 
 
 
272 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.46 
 
 
274 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  36.07 
 
 
273 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.94 
 
 
272 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.04 
 
 
313 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.05 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  37.24 
 
 
273 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.69 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.92 
 
 
295 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.36 
 
 
296 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.22 
 
 
270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  38.36 
 
 
273 aa  139  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.95 
 
 
270 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.83 
 
 
321 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  36.02 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  33.61 
 
 
301 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.71 
 
 
382 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.71 
 
 
382 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  31.08 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  36.76 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  35.11 
 
 
316 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.99 
 
 
269 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  36.99 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.61 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  37.86 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.89 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.98 
 
 
295 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  39.36 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.29 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.8 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 
260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.94 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.02 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.87 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.14 
 
 
269 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  35.16 
 
 
270 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.42 
 
 
649 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.1 
 
 
314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.15 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.08 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.16 
 
 
547 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.82 
 
 
324 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.86 
 
 
329 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  34.51 
 
 
280 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
319 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.06 
 
 
596 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.18 
 
 
290 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2985  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.55 
 
 
320 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000162336  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.7 
 
 
307 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.7 
 
 
269 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  33.78 
 
 
331 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  32.07 
 
 
288 aa  123  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  33.78 
 
 
331 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.62 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.84 
 
 
605 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.43 
 
 
350 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.48 
 
 
598 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  31.78 
 
 
297 aa  119  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.62 
 
 
831 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.47 
 
 
608 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.48 
 
 
598 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  27.3 
 
 
288 aa  119  9e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.07 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.63 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  35.1 
 
 
513 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.19 
 
 
566 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.13 
 
 
597 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.44 
 
 
316 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.35 
 
 
326 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.92 
 
 
611 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  30.99 
 
 
303 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.38 
 
 
334 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.6 
 
 
563 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.11 
 
 
656 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  34.42 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.89 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  32.43 
 
 
297 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.8 
 
 
298 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.77 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.67 
 
 
629 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.8 
 
 
298 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  31.9 
 
 
351 aa  113  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.42 
 
 
595 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  29.92 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  32.1 
 
 
601 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>