More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0542 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  100 
 
 
394 aa  796    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  55.84 
 
 
410 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.32 
 
 
296 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.58 
 
 
299 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.4 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.28 
 
 
299 aa  180  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.51 
 
 
342 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  44.26 
 
 
297 aa  179  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  43.78 
 
 
316 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.78 
 
 
382 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.78 
 
 
382 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.58 
 
 
313 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.49 
 
 
366 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.23 
 
 
339 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.13 
 
 
298 aa  169  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.97 
 
 
282 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.58 
 
 
282 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  40 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.51 
 
 
587 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.76 
 
 
295 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.6 
 
 
295 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.82 
 
 
297 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  38.43 
 
 
301 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.64 
 
 
290 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.82 
 
 
260 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.64 
 
 
336 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.08 
 
 
335 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.89 
 
 
274 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.36 
 
 
298 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.22 
 
 
613 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  41.71 
 
 
280 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.19 
 
 
616 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.19 
 
 
371 aa  146  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.24 
 
 
272 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.73 
 
 
605 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.21 
 
 
613 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.24 
 
 
272 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.63 
 
 
325 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  37.4 
 
 
608 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  38.91 
 
 
610 aa  143  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  34.87 
 
 
618 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.97 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.26 
 
 
617 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.4 
 
 
269 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.64 
 
 
615 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.01 
 
 
613 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.67 
 
 
656 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.72 
 
 
269 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42.41 
 
 
269 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.56 
 
 
307 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.29 
 
 
613 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  36.29 
 
 
633 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.95 
 
 
617 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  39.41 
 
 
609 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.91 
 
 
615 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.91 
 
 
615 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.33 
 
 
562 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.82 
 
 
270 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.91 
 
 
615 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.01 
 
 
614 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  38.06 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  40.21 
 
 
269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.86 
 
 
633 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.73 
 
 
598 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.73 
 
 
598 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.4 
 
 
595 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.8 
 
 
611 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.01 
 
 
614 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.01 
 
 
614 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.02 
 
 
290 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.01 
 
 
614 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.46 
 
 
615 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.66 
 
 
595 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  37.27 
 
 
612 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.46 
 
 
637 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  41.55 
 
 
270 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.8 
 
 
661 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  44.91 
 
 
269 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.91 
 
 
269 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.78 
 
 
593 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.78 
 
 
593 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.73 
 
 
327 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  40 
 
 
583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  37.83 
 
 
622 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  37.83 
 
 
618 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  37.83 
 
 
618 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  37.83 
 
 
618 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.08 
 
 
649 aa  133  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  36.51 
 
 
618 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  36.29 
 
 
623 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.53 
 
 
617 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  37.83 
 
 
618 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.83 
 
 
618 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.13 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  37.68 
 
 
513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  37.83 
 
 
618 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.5 
 
 
614 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.57 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.93 
 
 
589 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>