More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2985 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2985  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
320 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000162336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  61.56 
 
 
321 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  61.69 
 
 
323 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40 
 
 
329 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  39.75 
 
 
320 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.85 
 
 
335 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.5 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.61 
 
 
319 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.74 
 
 
336 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  35.83 
 
 
340 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.23 
 
 
348 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.63 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  39.47 
 
 
297 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.68 
 
 
327 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.02 
 
 
338 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  33.45 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  36.45 
 
 
326 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  37.56 
 
 
364 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.1 
 
 
282 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.99 
 
 
296 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  37.07 
 
 
364 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.34 
 
 
298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  37.69 
 
 
378 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  34.78 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.91 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  35.32 
 
 
610 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.63 
 
 
371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.87 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.87 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  37.11 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.98 
 
 
350 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.41 
 
 
351 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  36.15 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.44 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  36.84 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  35.44 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  39.05 
 
 
288 aa  129  9.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  36.68 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.29 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.13 
 
 
307 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.35 
 
 
547 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  35.29 
 
 
623 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.36 
 
 
299 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  35.48 
 
 
316 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.69 
 
 
350 aa  126  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  36.04 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  38.17 
 
 
300 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  33.86 
 
 
322 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.16 
 
 
329 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  36.18 
 
 
330 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  38.17 
 
 
290 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.16 
 
 
329 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.13 
 
 
299 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  35.68 
 
 
333 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  35.68 
 
 
333 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  35.68 
 
 
333 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  35.68 
 
 
333 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  35.68 
 
 
333 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  35.68 
 
 
333 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.99 
 
 
314 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  35.68 
 
 
333 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.46 
 
 
270 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.62 
 
 
382 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.62 
 
 
382 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  39.57 
 
 
301 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  37.1 
 
 
330 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  37.1 
 
 
330 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  37.1 
 
 
330 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.59 
 
 
329 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  36.02 
 
 
315 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.45 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  35.68 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  37.5 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  30.28 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.83 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.25 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.89 
 
 
260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  32.68 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  35.18 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  33.62 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  36.67 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.1 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  35.57 
 
 
325 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.69 
 
 
354 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  30.71 
 
 
312 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.57 
 
 
626 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  33.5 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  34.23 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.89 
 
 
295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.25 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.4 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  33.93 
 
 
329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  35.68 
 
 
387 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.69 
 
 
366 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  34.47 
 
 
569 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.27 
 
 
357 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  33.33 
 
 
269 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.07 
 
 
831 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>