More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1063 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  100 
 
 		 408 aa  819    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  34.22 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  33.21 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.98 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  38.07 
 
 		 288 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  39.43 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  32 
 
 		 781 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  33.47 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  39.79 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  29.7 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  33.33 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.38 
 
 		 371 aa  103  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  33.18 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  35.11 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  33.18 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.39 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  37.31 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  38.78 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  36.82 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  35.55 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  37.84 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  37.31 
 
 		 433 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.48 
 
 		 298 aa  99.8  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  37.84 
 
 		 448 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  31.84 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  32.72 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.48 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  32.72 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  30.05 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  34.26 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.74 
 
 		 291 aa  97.8  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.78 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.52 
 
 		 269 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  33.99 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.16 
 
 		 274 aa  97.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  35.23 
 
 		 273 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  37.3 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  30.2 
 
 		 340 aa  97.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.88 
 
 		 299 aa  96.3  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.86 
 
 		 286 aa  96.3  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.91 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  34.26 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.91 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  30.81 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  35.82 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  36.32 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.5 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  30.41 
 
 		 501 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.35 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  31.16 
 
 		 269 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.04 
 
 		 357 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  38.92 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.4 
 
 		 269 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.16 
 
 		 269 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.06 
 
 		 282 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  33.52 
 
 		 269 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.52 
 
 		 269 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  26.7 
 
 		 463 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  29.95 
 
 		 501 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.37 
 
 		 321 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.72 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.22 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  33.33 
 
 		 270 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  28.57 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.37 
 
 		 322 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  30.41 
 
 		 501 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  34.93 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  30.41 
 
 		 501 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.24 
 
 		 265 aa  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.7 
 
 		 269 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.88 
 
 		 321 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  34.19 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  29.49 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  30.47 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.51 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  31.31 
 
 		 461 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.64 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.38 
 
 		 298 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.59 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.83 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  35.75 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  27.2 
 
 		 270 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  26.96 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.74 
 
 		 287 aa  87.4  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  30.85 
 
 		 316 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.93 
 
 		 338 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.34 
 
 		 321 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  28.72 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  27.15 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  31.01 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.48 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.6 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.22 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.09 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.47 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  30.61 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.79 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>