More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7143 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  100 
 
 		 311 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  47.62 
 
 		 781 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  41.64 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  36.07 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  31.94 
 
 		 461 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  34.36 
 
 		 441 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  34.64 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  35.94 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  36.51 
 
 		 439 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  36.51 
 
 		 439 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  39.9 
 
 		 439 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  37.71 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  36.51 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  36.51 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  35.51 
 
 		 445 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  35.75 
 
 		 436 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.51 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  35.84 
 
 		 501 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  35.84 
 
 		 501 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  34.78 
 
 		 461 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  35.66 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.24 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  35.84 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  35.84 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.24 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  35.4 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  35.81 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.96 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  34.65 
 
 		 433 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  34.42 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  34.32 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  34.95 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  32.14 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  31.25 
 
 		 498 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  37.92 
 
 		 418 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.13 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  33.21 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  36.55 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  32.66 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.63 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  34.11 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.61 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  34.43 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  32.81 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  37.5 
 
 		 418 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  35.48 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.34 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  32.08 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  33 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  34.96 
 
 		 481 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  33.64 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.34 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  32.91 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  31.98 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.11 
 
 		 269 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  31.65 
 
 		 269 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.17 
 
 		 269 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.9 
 
 		 269 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.96 
 
 		 335 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.07 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  39.61 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.78 
 
 		 371 aa  96.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.56 
 
 		 617 aa  96.7  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  30.77 
 
 		 269 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.71 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.24 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  39.13 
 
 		 448 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  34.98 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  28.66 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  39.13 
 
 		 451 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  32.24 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.02 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.02 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  34.16 
 
 		 269 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.16 
 
 		 269 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  31.15 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  27.31 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.61 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.92 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.39 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.84 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.22 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32.37 
 
 		 350 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 		 348 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.78 
 
 		 547 aa  89.7  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.93 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  31.82 
 
 		 340 aa  89  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.34 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.94 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  33.7 
 
 		 610 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  32.95 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.71 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  32.39 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  29.71 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.18 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>