More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2745 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  78.23 
 
 
418 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  80.5 
 
 
436 aa  700    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  81.4 
 
 
433 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  79.67 
 
 
418 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  100 
 
 
410 aa  832    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  83.95 
 
 
433 aa  716    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  94.39 
 
 
392 aa  752    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  48.24 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  41.52 
 
 
441 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  54.12 
 
 
408 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  37.74 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  43.7 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  43.73 
 
 
461 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  36.09 
 
 
436 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  43.89 
 
 
316 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  40.56 
 
 
445 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  35.81 
 
 
498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  31.67 
 
 
463 aa  170  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  36.51 
 
 
501 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  36.18 
 
 
501 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  36.39 
 
 
501 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  36.18 
 
 
501 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  36.25 
 
 
501 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  37.32 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  35.03 
 
 
439 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  35.03 
 
 
439 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  35.03 
 
 
439 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  35.37 
 
 
439 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  35.37 
 
 
439 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  39.16 
 
 
374 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  42.03 
 
 
323 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  38.15 
 
 
288 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  41.64 
 
 
461 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  41.26 
 
 
481 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  32.37 
 
 
450 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  37.02 
 
 
420 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  37.01 
 
 
301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  36.61 
 
 
323 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  36.26 
 
 
292 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  38.28 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  38.29 
 
 
448 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  30.69 
 
 
306 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  37.91 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40.09 
 
 
302 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  32.66 
 
 
311 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  29.62 
 
 
781 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  33.19 
 
 
314 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  30.04 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.42 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  38.92 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.38 
 
 
376 aa  93.2  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.36 
 
 
290 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  37.65 
 
 
273 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  33.78 
 
 
321 aa  86.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.96 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.85 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  30.05 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.81 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.16 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.68 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.94 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.85 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.16 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.71 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  28.23 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.61 
 
 
831 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.19 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.91 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  31.53 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  32.34 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  33.04 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  32.43 
 
 
593 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.13 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  32.46 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  29.63 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.74 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.63 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.3 
 
 
290 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.63 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  25.94 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.14 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.97 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.9 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  31.5 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.52 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.65 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  30.51 
 
 
569 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.52 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  28.37 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.91 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  33.33 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.07 
 
 
595 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  31.79 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.23 
 
 
596 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.83 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  32.5 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.77 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  33.71 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>