More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3650 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  100 
 
 		 323 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  51.19 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  47.62 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  41.26 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  40.2 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  43.35 
 
 		 501 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  42.92 
 
 		 501 aa  175  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  42.92 
 
 		 501 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  42.92 
 
 		 501 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  42.92 
 
 		 501 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  36.46 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  37.04 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  38.63 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  36.61 
 
 		 410 aa  165  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  35.16 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  41.82 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  45.18 
 
 		 420 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  36.36 
 
 		 433 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  35.69 
 
 		 433 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  35.58 
 
 		 439 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  35.58 
 
 		 439 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  32.88 
 
 		 450 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  39.07 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  40.73 
 
 		 448 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  35.46 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  41.09 
 
 		 451 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  35.46 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  37.5 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  39.53 
 
 		 439 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  38.31 
 
 		 416 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  38.89 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  38.46 
 
 		 418 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  39.22 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  39.65 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  36.36 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  37.69 
 
 		 445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  33.03 
 
 		 463 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  31.79 
 
 		 353 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  32.23 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  32.39 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  38.5 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  34.05 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  33.69 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  34.04 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  33.9 
 
 		 461 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  32.71 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  30.64 
 
 		 781 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  35.75 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  31.19 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  33.79 
 
 		 321 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.57 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.02 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.58 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.96 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.84 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.63 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.93 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  29.71 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  29.71 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.02 
 
 		 570 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  32.07 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  31.72 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.63 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  29.95 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  31.68 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.14 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  29.41 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.67 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.72 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.21 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  25 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.23 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  28.42 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.7 
 
 		 596 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.65 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  26.52 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  25.1 
 
 		 601 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.35 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  30.23 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.16 
 
 		 597 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  28.28 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  28.02 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.62 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  28.28 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  27.17 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.27 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  29.03 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.52 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  27.91 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  26.94 
 
 		 569 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.63 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.85 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  26.69 
 
 		 583 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.04 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.25 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.16 
 
 		 597 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.23 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  27.27 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.7 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.81 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>