More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1618 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  100 
 
 
316 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  63.47 
 
 
323 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  47.81 
 
 
441 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  41.03 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  49.28 
 
 
416 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  49.54 
 
 
408 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  46.26 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  44.8 
 
 
392 aa  182  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  43.89 
 
 
410 aa  182  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  44.44 
 
 
436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  47.98 
 
 
353 aa  179  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  43.56 
 
 
433 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  43.56 
 
 
418 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  42.67 
 
 
433 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  38.82 
 
 
498 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  34.65 
 
 
439 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  34.65 
 
 
439 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  37.63 
 
 
461 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  33.77 
 
 
439 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  33.77 
 
 
439 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  34.64 
 
 
439 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  34.21 
 
 
501 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  40.59 
 
 
463 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  36.46 
 
 
445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  35.71 
 
 
436 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  33.55 
 
 
501 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  33.22 
 
 
501 aa  152  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  33.22 
 
 
501 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  33.22 
 
 
501 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  35.07 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  31.39 
 
 
450 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  39.07 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  36.82 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  34.03 
 
 
293 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  33.44 
 
 
301 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  38.59 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  40.65 
 
 
420 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.91 
 
 
311 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  32.12 
 
 
481 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  34.4 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  37.99 
 
 
461 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  34.73 
 
 
374 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  37.82 
 
 
448 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  37.74 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.18 
 
 
290 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  32.14 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  37.4 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  33.93 
 
 
781 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.86 
 
 
307 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  33.76 
 
 
402 aa  106  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.16 
 
 
274 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  35.32 
 
 
321 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  36.1 
 
 
314 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.05 
 
 
327 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0322  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.83 
 
 
307 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491128  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.38 
 
 
307 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.67 
 
 
335 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.51 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.52 
 
 
596 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.39 
 
 
311 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.79 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.84 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  34.16 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.85 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.67 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  34.57 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.82 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  30.05 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.63 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  30.05 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.03 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.12 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.06 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 
322 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.15 
 
 
320 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  33 
 
 
316 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.02 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33 
 
 
382 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.79 
 
 
371 aa  93.2  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33 
 
 
382 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  33.16 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.07 
 
 
331 aa  92.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  30.33 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.56 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  30.81 
 
 
288 aa  92  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.29 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.74 
 
 
597 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  31.43 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.32 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.63 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.43 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  30.45 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.77 
 
 
339 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.28 
 
 
295 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  34.13 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.44 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  34.17 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  29.25 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>