More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1819 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  100 
 
 		 383 aa  782    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  45.35 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  45.04 
 
 		 441 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  45.45 
 
 		 433 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  45.35 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  44.93 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  46.62 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  41.01 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  45.38 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  44.62 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  41.03 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  43.63 
 
 		 392 aa  202  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  48.39 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  44.6 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  43.48 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  43.32 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  38.28 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  39.56 
 
 		 461 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  37.73 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  37.64 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  34.77 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  37.32 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  41.18 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  41.18 
 
 		 451 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  41.7 
 
 		 448 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  34.93 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  44.64 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  36.55 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  34.56 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  34.19 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  34.19 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  34.56 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  39.86 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  38.63 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  34.07 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  34.07 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  34.07 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  34.43 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  34.43 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  33.46 
 
 		 450 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  41.78 
 
 		 461 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  35.34 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  39.24 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  34.64 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  40.57 
 
 		 481 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  35.68 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  34.24 
 
 		 781 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  30.05 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.97 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.58 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.03 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.5 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.01 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  30.86 
 
 		 300 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  32.67 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.44 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  28.37 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  35.06 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  30.28 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  35.29 
 
 		 288 aa  96.3  9e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.92 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  30.14 
 
 		 361 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  29.67 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  31.9 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.73 
 
 		 307 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.53 
 
 		 327 aa  93.2  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  31.87 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.86 
 
 		 274 aa  92.8  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  30.14 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.86 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.43 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.91 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.18 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  30.95 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.13 
 
 		 336 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 321 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.41 
 
 		 331 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  28.64 
 
 		 315 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.22 
 
 		 597 aa  89.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.53 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.86 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.18 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  29.05 
 
 		 364 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.84 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  28.57 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.53 
 
 		 299 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  30.72 
 
 		 297 aa  87.4  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.27 
 
 		 313 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.25 
 
 		 596 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.28 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  27.4 
 
 		 314 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  33.71 
 
 		 331 aa  86.7  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.13 
 
 		 320 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.64 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  33.71 
 
 		 331 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.58 
 
 		 324 aa  86.3  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.84 
 
 		 307 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  28.88 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.07 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>