More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2091 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  100 
 
 
288 aa  590  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  54.3 
 
 
293 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  53.24 
 
 
292 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  41.22 
 
 
436 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  43.32 
 
 
383 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  39.58 
 
 
441 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  41.26 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  36.79 
 
 
439 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  36.79 
 
 
439 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  37.32 
 
 
501 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  37.32 
 
 
501 aa  185  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  37.32 
 
 
501 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  36.86 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  36.43 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  36.43 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  36.43 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  36.59 
 
 
501 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  36.59 
 
 
501 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  36.23 
 
 
450 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  41.43 
 
 
416 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  40.43 
 
 
408 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  38.15 
 
 
436 aa  175  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  37.64 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  38.15 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  36.9 
 
 
433 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  38.99 
 
 
445 aa  168  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  43.84 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  41.1 
 
 
463 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  42.36 
 
 
418 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  42.36 
 
 
418 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  36.82 
 
 
316 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  34.56 
 
 
306 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  47.73 
 
 
420 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  33.8 
 
 
461 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  34.26 
 
 
323 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  39.62 
 
 
448 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  35 
 
 
301 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  39.62 
 
 
448 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  44.95 
 
 
353 aa  148  9e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  39.25 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  39.72 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  32.86 
 
 
374 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  33.22 
 
 
781 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  38.07 
 
 
408 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  31.21 
 
 
481 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  32.81 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  32.34 
 
 
461 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  34.4 
 
 
402 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  32.88 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  30.37 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.23 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  29.58 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.93 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.78 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  29.63 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.8 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  30.1 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  31.4 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.71 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.28 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  29.67 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  31.64 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.18 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  31.22 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  30.6 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  26.79 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.76 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  30.56 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.78 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.27 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.54 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  29.03 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  29.27 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.11 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  28.95 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.42 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  27.53 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.68 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  29.13 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  28.12 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  30 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  31.82 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.16 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  26.15 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  29.61 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  31.33 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.67 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  27.6 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  30 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  27.6 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  23.65 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  24.66 
 
 
605 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  27.75 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  33.69 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  28.95 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  30.21 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  30.21 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  30.21 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0409  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.927346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>