More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2046 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  95.44 
 
 		 418 aa  813    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  97.44 
 
 		 436 aa  852    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  100 
 
 		 433 aa  877    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  98.08 
 
 		 418 aa  827    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  81.4 
 
 		 410 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  94.92 
 
 		 433 aa  832    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  80.1 
 
 		 392 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  45.99 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  41.19 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  53.05 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  34.96 
 
 		 353 aa  207  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  43.84 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  43.17 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  33.79 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  43.56 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  39.02 
 
 		 445 aa  176  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  36.71 
 
 		 436 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  35.37 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  36.81 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  35.25 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  35.25 
 
 		 501 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  34.92 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  34.92 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  34.92 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  35.23 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  35.23 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  34.56 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  34.56 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  34.56 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  37.63 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  40 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  36.9 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  35.44 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  35.74 
 
 		 292 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  36.75 
 
 		 301 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  30.68 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  43.58 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  35.69 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  44.5 
 
 		 481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  31.69 
 
 		 306 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  38.01 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  37.64 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  37.27 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  34.32 
 
 		 311 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  39.25 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  34.77 
 
 		 781 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  28.63 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  34.88 
 
 		 314 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  36.32 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.65 
 
 		 274 aa  94  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  31.62 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.8 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  30.89 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.97 
 
 		 331 aa  87.8  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31 
 
 		 298 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.66 
 
 		 299 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.95 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.89 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  29.63 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.08 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.32 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.39 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  31.63 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.81 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  35.27 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.65 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.43 
 
 		 831 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.19 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.08 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  34 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.77 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.92 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.56 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.98 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.29 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.72 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.63 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  29.64 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  28.76 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  29.45 
 
 		 583 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  29.28 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  30.37 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.52 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  35.19 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.65 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  33.74 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.78 
 
 		 605 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  27.49 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.84 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.84 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.84 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.36 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.13 
 
 		 269 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  34.13 
 
 		 269 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  28.44 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  31.82 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  31.21 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.22 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.1 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.57 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>