More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2584 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  100 
 
 		 327 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  93.43 
 
 		 305 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  87.46 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  38.14 
 
 		 461 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  40.72 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  37.44 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  40.64 
 
 		 300 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  41.18 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  36.25 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  34.38 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  34.42 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  41.53 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  32.92 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  31.05 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  31.05 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  31.05 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  33.33 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  33.74 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  31.25 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  31.25 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  33.74 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  32.1 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  31.67 
 
 		 501 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  34.1 
 
 		 418 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  31.87 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  32.42 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  35.03 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  38.12 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  30.61 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  37.62 
 
 		 448 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  31.67 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  31.46 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  38.74 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  31.22 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  31.22 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  40 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  33.73 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  29.66 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  34.39 
 
 		 781 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  31.2 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  28.26 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  45.24 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  33.71 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  33.33 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  33.93 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  33.46 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  31.05 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.07 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  29.27 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  29.65 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  36.49 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  41.38 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0026  peptidase S49  29.69 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0292498  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  30.28 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.47 
 
 		 621 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.74 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  40.24 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  42.86 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  40.24 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.97 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.71 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.25 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.46 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  40.96 
 
 		 566 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.78 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  34.15 
 
 		 609 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.61 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  33.02 
 
 		 463 aa  55.8  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  38.2 
 
 		 616 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.56 
 
 		 593 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.56 
 
 		 593 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  33.68 
 
 		 608 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  42.17 
 
 		 623 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.82 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.1 
 
 		 629 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.29 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1397  peptidase S49  29.71 
 
 		 550 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.42 
 
 		 656 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  31.88 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.73 
 
 		 640 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.24 
 
 		 620 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.21 
 
 		 613 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.47 
 
 		 614 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  32.93 
 
 		 611 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.75 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.06 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.32 
 
 		 605 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0198  peptidase S49  43.59 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.17 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  27.27 
 
 		 550 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.65 
 
 		 626 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.57 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.1 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  42.47 
 
 		 616 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.28 
 
 		 585 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.18 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.78 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.24 
 
 		 615 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>