More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0026 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0026  peptidase S49  100 
 
 		 417 aa  821    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.12 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.42 
 
 		 272 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  32.13 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  32.14 
 
 		 270 aa  106  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  30.92 
 
 		 273 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.16 
 
 		 270 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.86 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.48 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.91 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.99 
 
 		 299 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  29.72 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.27 
 
 		 339 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.14 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.5 
 
 		 269 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  33.5 
 
 		 269 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  33.16 
 
 		 270 aa  93.6  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  28.57 
 
 		 272 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  31.06 
 
 		 350 aa  90.5  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  30.28 
 
 		 270 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.31 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.55 
 
 		 298 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  31.28 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.24 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  29.39 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.31 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.92 
 
 		 287 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.13 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.56 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  30.62 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.32 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  29.76 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.69 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.62 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.33 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  28.99 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  32.49 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  30.05 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.96 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  28.57 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.69 
 
 		 319 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.3 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.68 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  30.1 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.68 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.69 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  31.55 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.9 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.6 
 
 		 831 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.72 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  31.54 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  30.22 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.55 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0781  protease IV, putative  33.5 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  29.77 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  31.84 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  29.26 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.83 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  28.96 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.52 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.52 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.78 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.15 
 
 		 594 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.47 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  29.13 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.76 
 
 		 593 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.64 
 
 		 321 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.71 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  29.65 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.55 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  28.65 
 
 		 361 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.84 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.5 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  30.92 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.23 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  28.27 
 
 		 608 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.28 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  29.83 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  30.33 
 
 		 623 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  29.26 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  34.19 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.25 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  30.81 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.84 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.85 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  29.35 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.08 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.85 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.02 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  23.64 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.33 
 
 		 611 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.95 
 
 		 595 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  25.64 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  32.24 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  26.89 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.5 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.85 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.35 
 
 		 595 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>