More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3063 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  58.02 
 
 		 292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  54.3 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  51.19 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  41.84 
 
 		 436 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  41.03 
 
 		 501 aa  224  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  41.03 
 
 		 501 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  40.34 
 
 		 501 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  40.34 
 
 		 501 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  40.91 
 
 		 501 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  38.19 
 
 		 450 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  42.66 
 
 		 441 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  38.57 
 
 		 439 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  38.57 
 
 		 439 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  38.23 
 
 		 439 aa  211  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  38.23 
 
 		 439 aa  211  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  38.16 
 
 		 498 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  43.48 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  42.12 
 
 		 408 aa  195  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  41.41 
 
 		 416 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  36.48 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  39.44 
 
 		 436 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  38.89 
 
 		 433 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  39.58 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  39.44 
 
 		 410 aa  181  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  44.03 
 
 		 420 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  40.22 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  46.95 
 
 		 418 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  45.35 
 
 		 448 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  45.54 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  44.28 
 
 		 448 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  44.96 
 
 		 451 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  46.95 
 
 		 392 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  41.1 
 
 		 463 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  32.78 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  34.03 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  36.46 
 
 		 461 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  33.56 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  33.7 
 
 		 374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  43 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  34.94 
 
 		 461 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  34.81 
 
 		 481 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40.09 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  33.22 
 
 		 781 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  34.43 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  39.79 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  34.13 
 
 		 402 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  34.74 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.22 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  33.98 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.41 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  34.24 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  32.68 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  34 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  34.86 
 
 		 360 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.08 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.97 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.59 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.9 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.64 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.19 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  30.63 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.44 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  32.77 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.58 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.68 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  30.68 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  32 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32.37 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.09 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.22 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.63 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  30.98 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.41 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  32.77 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  30.43 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.52 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.76 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.8 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  27.78 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.41 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  31.87 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  28.8 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.82 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 		 831 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  30.43 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.41 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.56 
 
 		 585 aa  75.5  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.95 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.03 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.14 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  29.49 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.37 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  28.96 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.9 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>