More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0454 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
311 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  58.8 
 
 
334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  63.26 
 
 
331 aa  320  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  60 
 
 
331 aa  316  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.21 
 
 
339 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.27 
 
 
313 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  37.6 
 
 
297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.11 
 
 
311 aa  135  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.42 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.5 
 
 
291 aa  134  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.7 
 
 
296 aa  132  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.04 
 
 
298 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.94 
 
 
296 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.47 
 
 
299 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.1 
 
 
371 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.04 
 
 
298 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.89 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.87 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.04 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  39.78 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.76 
 
 
307 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.55 
 
 
287 aa  126  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.48 
 
 
366 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.16 
 
 
290 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.27 
 
 
335 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.21 
 
 
319 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  35.83 
 
 
301 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.78 
 
 
336 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  33.5 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.46 
 
 
382 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.46 
 
 
382 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.52 
 
 
260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  30.6 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.81 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.66 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.77 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  36.17 
 
 
332 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.5 
 
 
329 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  35.87 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.83 
 
 
325 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.02 
 
 
269 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  33.02 
 
 
269 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  34.72 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.98 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.6 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  36.07 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  33.33 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.33 
 
 
269 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.13 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.02 
 
 
287 aa  116  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  34.87 
 
 
349 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  30.56 
 
 
351 aa  116  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  33.77 
 
 
326 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  30.3 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  33.6 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.08 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.65 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  34.25 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.8 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  28.36 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.67 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.17 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.67 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  33.33 
 
 
360 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.29 
 
 
339 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  35.07 
 
 
273 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  28.36 
 
 
364 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  36.84 
 
 
289 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  31.3 
 
 
340 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  33.64 
 
 
272 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  33.69 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  32.9 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  34.67 
 
 
280 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  31.82 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.49 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  32.89 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  33.33 
 
 
361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.06 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.92 
 
 
608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.02 
 
 
348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.68 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  33.21 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.21 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.77 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  34.91 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.14 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.77 
 
 
329 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  32.89 
 
 
329 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.82 
 
 
563 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  31.41 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.99 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  33.02 
 
 
312 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.62 
 
 
307 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.76 
 
 
341 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  32.08 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  33.33 
 
 
297 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>