More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01981 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  932    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  46.15 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  46.15 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  44.82 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  45.79 
 
 		 439 aa  359  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  45.79 
 
 		 439 aa  359  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  44.02 
 
 		 436 aa  346  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  41.5 
 
 		 498 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  40.19 
 
 		 501 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  41.11 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  41.11 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  40.19 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  40.43 
 
 		 501 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  38.19 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  30.71 
 
 		 461 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  34.74 
 
 		 301 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  36.23 
 
 		 288 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  34.15 
 
 		 292 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  31.18 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  34.93 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  34.93 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  31.12 
 
 		 481 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  34.56 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  33.33 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  32.37 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  36.45 
 
 		 323 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  32.65 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  30.77 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  32.53 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  31.34 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  30.68 
 
 		 433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  36.51 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  31.39 
 
 		 316 aa  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  33.33 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  29.84 
 
 		 306 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  33.33 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  31.7 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  33.46 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  31.25 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  34.02 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  30.65 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  36.74 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  29.07 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  35.48 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  36.08 
 
 		 201 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  28.72 
 
 		 781 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  31.67 
 
 		 302 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  28.57 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.43 
 
 		 311 aa  86.7  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.38 
 
 		 331 aa  86.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.79 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.79 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  26.32 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.75 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.21 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.98 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  25.88 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  25.73 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.76 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  31.55 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  31.78 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.61 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  26.64 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  27.6 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.78 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.24 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  23.08 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.91 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.17 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  24.02 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  25.42 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.01 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  26.82 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  26.82 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  25.43 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.04 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.13 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  26.34 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.41 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.43 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.14 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  26.2 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  26.5 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  28.84 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  22 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.22 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  26.07 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.83 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.07 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  26.27 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.82 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.8 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.5 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.02 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.49 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  24.27 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  25.73 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  22.57 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.05 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>