More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1289 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  98.2 
 
 		 501 aa  996    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  100 
 
 		 501 aa  1011    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  97.41 
 
 		 501 aa  956    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  65.07 
 
 		 498 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  96.61 
 
 		 501 aa  929    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  96.61 
 
 		 501 aa  929    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  53.88 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  53.88 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  53.4 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  53.64 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  53.4 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  50.87 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  39.57 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  41.03 
 
 		 293 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  37.32 
 
 		 288 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  34.53 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  41.22 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  38.93 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  39.38 
 
 		 408 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  41.35 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  37.93 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  36.57 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  39.32 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  33.16 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  40.86 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  35.25 
 
 		 433 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  35.25 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  35.37 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  35.56 
 
 		 292 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  41.26 
 
 		 418 aa  163  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  40.81 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  42.15 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  34.97 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  33.99 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  34.48 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  42.92 
 
 		 323 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  34.21 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  34.93 
 
 		 383 aa  156  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  33.33 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  35.15 
 
 		 323 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  35.93 
 
 		 374 aa  143  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  38.86 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  29.58 
 
 		 306 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  35.84 
 
 		 311 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  44.07 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  37.43 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  33.33 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.84 
 
 		 339 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  29.95 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  33.87 
 
 		 326 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  32.26 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  27.46 
 
 		 327 aa  88.2  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  27.05 
 
 		 781 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32.4 
 
 		 350 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  32.96 
 
 		 356 aa  86.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.42 
 
 		 350 aa  86.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.18 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.8 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  27.35 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  31.72 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  26.94 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  30.6 
 
 		 313 aa  83.2  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.73 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  30 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  31.01 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  31.05 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.11 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.51 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.22 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  32.22 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  31.64 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.63 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  31.11 
 
 		 336 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.9 
 
 		 321 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  30.9 
 
 		 312 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  30.48 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  30.34 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.5 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.65 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.77 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.31 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.38 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  28.14 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  30.39 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.27 
 
 		 287 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  29.03 
 
 		 340 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  27.8 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.74 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.88 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  33.52 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  27.6 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  28.42 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 		 604 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  28.15 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.12 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>