More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3173 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  100 
 
 
781 aa  1573    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  47.62 
 
 
311 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  42.72 
 
 
302 aa  210  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  29.31 
 
 
624 aa  183  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  28.88 
 
 
624 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  28.63 
 
 
624 aa  180  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  28.63 
 
 
624 aa  180  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  28.76 
 
 
663 aa  168  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  30.36 
 
 
409 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  32.32 
 
 
416 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  36.15 
 
 
315 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  35.31 
 
 
300 aa  135  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  37.61 
 
 
461 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  36.61 
 
 
314 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  33.22 
 
 
288 aa  127  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  33.57 
 
 
383 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  34.46 
 
 
299 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  30.08 
 
 
410 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  30.64 
 
 
392 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  33.22 
 
 
293 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  32 
 
 
408 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  33.65 
 
 
374 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  35.94 
 
 
436 aa  122  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  34.42 
 
 
463 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.88 
 
 
339 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  29.44 
 
 
418 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  33.93 
 
 
316 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  36.65 
 
 
420 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  34.77 
 
 
433 aa  117  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  33.55 
 
 
441 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  32.29 
 
 
445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  35.29 
 
 
418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  30.17 
 
 
436 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  35.16 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5508  hypothetical protein  30.3 
 
 
438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.68 
 
 
296 aa  112  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  33.49 
 
 
353 aa  111  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.06 
 
 
299 aa  111  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  26.74 
 
 
439 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  26.74 
 
 
439 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  30.09 
 
 
481 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.07 
 
 
295 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  26.47 
 
 
439 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.8 
 
 
313 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  33.45 
 
 
292 aa  108  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.3 
 
 
270 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  34.19 
 
 
416 aa  107  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  28.72 
 
 
450 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  33.49 
 
 
340 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  25.94 
 
 
439 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  25.94 
 
 
439 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  30.64 
 
 
323 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  30.43 
 
 
323 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  29.61 
 
 
461 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.32 
 
 
605 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.06 
 
 
366 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.29 
 
 
274 aa  102  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.87 
 
 
587 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  32.86 
 
 
297 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.6 
 
 
299 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.91 
 
 
326 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  29.12 
 
 
498 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  27.05 
 
 
501 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.29 
 
 
615 aa  100  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.47 
 
 
282 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  32.82 
 
 
273 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 
327 aa  100  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.15 
 
 
295 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.91 
 
 
274 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.08 
 
 
272 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  32.98 
 
 
269 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.98 
 
 
269 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.3 
 
 
617 aa  99.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.03 
 
 
617 aa  99.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.08 
 
 
272 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  32.99 
 
 
270 aa  99.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  30.06 
 
 
321 aa  99  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  26.71 
 
 
501 aa  99  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.86 
 
 
621 aa  98.2  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  26.71 
 
 
501 aa  98.2  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  26.37 
 
 
501 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  26.37 
 
 
501 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  31.19 
 
 
269 aa  97.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.48 
 
 
260 aa  97.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  35.19 
 
 
408 aa  96.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.67 
 
 
335 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  30.3 
 
 
569 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  32.2 
 
 
270 aa  97.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  32.78 
 
 
269 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.74 
 
 
831 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.58 
 
 
614 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.58 
 
 
614 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  30.68 
 
 
610 aa  96.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.41 
 
 
298 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.62 
 
 
613 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.44 
 
 
613 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.19 
 
 
335 aa  95.1  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  31.46 
 
 
270 aa  95.1  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  31.11 
 
 
269 aa  95.1  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  29.82 
 
 
320 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>