More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0282 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  100 
 
 		 299 aa  590  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  76.14 
 
 		 300 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  43.86 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  45.95 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  42.08 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  36.39 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  32.08 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  34.46 
 
 		 781 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  38.63 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  38.63 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  38.18 
 
 		 461 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  36.53 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  30.34 
 
 		 463 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  38.14 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  32.31 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  32.2 
 
 		 433 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  36.4 
 
 		 416 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  32.9 
 
 		 392 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  31.51 
 
 		 436 aa  89  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  31.36 
 
 		 436 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  33.8 
 
 		 445 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  30.93 
 
 		 418 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  30.93 
 
 		 433 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  36.24 
 
 		 408 aa  86.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  31.78 
 
 		 383 aa  85.9  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  30.93 
 
 		 418 aa  85.9  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  33.94 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  32.76 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  31.88 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  33.19 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  33.33 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  33.8 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  30.53 
 
 		 501 aa  79.7  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  33.66 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.32 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  29.58 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  28.76 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  33.79 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  29.1 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  30.53 
 
 		 501 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  30 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  30.09 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  30.09 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  30.09 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  33.52 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.77 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.71 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1336  peptidase S49  27.5 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.72 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.77 
 
 		 605 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  31.66 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.98 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  28.21 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  28.05 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  28.41 
 
 		 608 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  31.51 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  30.98 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  31.22 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  28.5 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.35 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  28.57 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.4 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  29.51 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  31.84 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.32 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.07 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  31.84 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  31.15 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  31.84 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  32.68 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  30.46 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  26.67 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  28.85 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.87 
 
 		 617 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  31.96 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  31.71 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  31.71 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  31.71 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  30.99 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  31.71 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  31.71 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  31.71 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  30.86 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  32.07 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.16 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  31.28 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  31.71 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  29.52 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  33.13 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  30.23 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.84 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  33.83 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  31.34 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  31.6 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  32.98 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.8 
 
 		 593 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.63 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.8 
 
 		 593 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>