More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1336 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1336  peptidase S49  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  31.31 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  29.85 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  30.85 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.69 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  26.99 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  30.39 
 
 
552 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  30.32 
 
 
436 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.07 
 
 
324 aa  72  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.13 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.03 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  29.21 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  30.39 
 
 
550 aa  69.7  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  30.67 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  31.53 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  28.64 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  29.33 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  29.45 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  32.09 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  31.53 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.3 
 
 
357 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  28.71 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  28.22 
 
 
522 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  28.74 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  30.43 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1397  peptidase S49  28.18 
 
 
550 aa  65.5  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  28.4 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  28.34 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  30.69 
 
 
461 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  28.4 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.93 
 
 
326 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.42 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  29.67 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  29.28 
 
 
408 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  29.81 
 
 
333 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  31.25 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  29.81 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  29.81 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  29.81 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  29.81 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  29.81 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  29.81 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  35.25 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.55 
 
 
376 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  29.81 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  27.78 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  31.07 
 
 
445 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.66 
 
 
350 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  29.35 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  27.51 
 
 
303 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  28.12 
 
 
329 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  29.48 
 
 
330 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  28.11 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.21 
 
 
339 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  28.92 
 
 
329 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  28.65 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  27.44 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.92 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  31.32 
 
 
481 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  29.35 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  28.02 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  30.56 
 
 
501 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  31.48 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  29.53 
 
 
374 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  29.33 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  29.63 
 
 
356 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.5 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  29.01 
 
 
330 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  29.01 
 
 
330 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  29.01 
 
 
330 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  29.01 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.78 
 
 
326 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.45 
 
 
382 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  28.22 
 
 
360 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.86 
 
 
341 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.8 
 
 
382 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.8 
 
 
382 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.37 
 
 
371 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  27.68 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  27.62 
 
 
353 aa  59.3  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  29.45 
 
 
361 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.21 
 
 
331 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  28.02 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  27.61 
 
 
315 aa  59.3  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  29.38 
 
 
330 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  29.63 
 
 
326 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  29.38 
 
 
330 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.26 
 
 
329 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0781  protease IV, putative  25.41 
 
 
332 aa  58.5  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  30.09 
 
 
501 aa  58.9  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  29.38 
 
 
349 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.19 
 
 
299 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  29.38 
 
 
349 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  29.38 
 
 
349 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  29.38 
 
 
349 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  29.38 
 
 
349 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  30.77 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  29.38 
 
 
349 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  28.64 
 
 
501 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  28.83 
 
 
313 aa  58.5  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>