More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1457 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  100 
 
 		 501 aa  1012    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  97.21 
 
 		 501 aa  936    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  97.21 
 
 		 501 aa  936    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  99.2 
 
 		 501 aa  1004    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  65.47 
 
 		 498 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  98.2 
 
 		 501 aa  996    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  54.13 
 
 		 439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  54.13 
 
 		 439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  53.64 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  53.64 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  53.88 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  50.62 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  39.34 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  41.03 
 
 		 293 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  41.22 
 
 		 451 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  37.32 
 
 		 288 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  41.35 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  40.86 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  33.93 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  38.57 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  36.25 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  39.04 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  37.24 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  38.98 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  34.92 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  34.92 
 
 		 433 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  32.89 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  35.56 
 
 		 292 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  35.03 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  33.66 
 
 		 301 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  40.81 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  43.35 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  40.36 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  41.7 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  34.68 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  33.33 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  33.55 
 
 		 316 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  34.56 
 
 		 383 aa  153  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  32.97 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  34.47 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  36.03 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  38.39 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  30.23 
 
 		 306 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  44.07 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  35.4 
 
 		 311 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  33.78 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  36.9 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.31 
 
 		 339 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  33.87 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  29.49 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.63 
 
 		 350 aa  86.7  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.29 
 
 		 376 aa  86.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  32.26 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  26.71 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  25.76 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.18 
 
 		 332 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  31.28 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  31.72 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.18 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  31.84 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  26.53 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  30.63 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.94 
 
 		 321 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  26.12 
 
 		 364 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  28.8 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  29.95 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.33 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.11 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.5 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  30.53 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  28.17 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.18 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.25 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.63 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.94 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  29.84 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  29.49 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  29.79 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.12 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  31.11 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  30 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  28.77 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.89 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  29.41 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  28.14 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  28.57 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  29.78 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  28.05 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.65 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.48 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.8 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.74 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  27.14 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.73 
 
 		 287 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 		 604 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.81 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  29.94 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>