More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0595 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  100 
 
 		 420 aa  823    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  38.93 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  42.12 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  38.59 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  38.59 
 
 		 501 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  35.75 
 
 		 501 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  35.75 
 
 		 501 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  44.03 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  39.39 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  38.03 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  47.37 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  42.47 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  40.5 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  41.89 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  40.43 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  40 
 
 		 383 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  44.68 
 
 		 292 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  41.06 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  41.33 
 
 		 481 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  39.45 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  41.06 
 
 		 418 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  35.53 
 
 		 439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  35.53 
 
 		 439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  36.16 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  35.53 
 
 		 439 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  45.18 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  35.24 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  35.24 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  31.25 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  38.27 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  47.73 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  38.64 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  48.16 
 
 		 448 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  40.62 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  47.76 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  42.72 
 
 		 353 aa  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  40.65 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  47.35 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  41.46 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  43.46 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  36.48 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  38.36 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  38.46 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  37.93 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  32.54 
 
 		 781 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  34.98 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  33.2 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  34.67 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.35 
 
 		 327 aa  96.3  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.89 
 
 		 298 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.03 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.05 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  33.46 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  34.24 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.58 
 
 		 274 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.05 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.89 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  34.62 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  32.4 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32.07 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.59 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  33.71 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  33.71 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.33 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.91 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.47 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.71 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  31.43 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.95 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.34 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  30.29 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.79 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.78 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.96 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  32.97 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.25 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  30.73 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  31.71 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.81 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.51 
 
 		 314 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.4 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.26 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  28.85 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.48 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.8 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.5 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  31.22 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  33.33 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  33.53 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  29.8 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  25.56 
 
 		 601 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  28.76 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  31.5 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  37.08 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.4 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>