More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2894 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  78.23 
 
 		 418 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  80.14 
 
 		 436 aa  663    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  80.1 
 
 		 433 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  78.71 
 
 		 418 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  94.39 
 
 		 410 aa  752    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  82.25 
 
 		 433 aa  684    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  100 
 
 		 392 aa  791    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  47.53 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  41.9 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  53.02 
 
 		 408 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  36.76 
 
 		 353 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  41.92 
 
 		 383 aa  186  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  42.86 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  44.8 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  48.11 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  42.67 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  39.64 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  42.15 
 
 		 501 aa  162  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  42.15 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  41.7 
 
 		 501 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  41.7 
 
 		 501 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  41.7 
 
 		 501 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  43 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  35.36 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  42.65 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  42.65 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  44.13 
 
 		 293 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  41.71 
 
 		 439 aa  154  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  41.71 
 
 		 439 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  41.71 
 
 		 439 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  40.15 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  43.84 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  43.38 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  36.51 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  42.16 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  35.98 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  38.01 
 
 		 374 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  39.22 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  39.81 
 
 		 301 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  43.42 
 
 		 448 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  34.07 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  42.86 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  41.46 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  36.55 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  39.27 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  31.2 
 
 		 781 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  38.78 
 
 		 408 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  34.2 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.08 
 
 		 274 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  29.18 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.56 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.23 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.38 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  33.79 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.13 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.5 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  28.63 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.68 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  33.08 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  31.16 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.19 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  33.04 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  32.24 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  33.33 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.78 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  37.04 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.56 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.85 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.04 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.49 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  30.45 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.28 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.02 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.78 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.15 
 
 		 595 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.15 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.81 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.71 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.13 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.72 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.62 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.84 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.62 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.63 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  29.56 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.62 
 
 		 661 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  33.33 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  28.04 
 
 		 608 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  29.44 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.15 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.41 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.99 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  32.76 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.33 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.05 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  32.08 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.28 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>