More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0858 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  100 
 
 		 416 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  66.51 
 
 		 441 aa  511  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  72.66 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  48.24 
 
 		 410 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  46.1 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  45.99 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  45.99 
 
 		 433 aa  309  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  47.53 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  46.19 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  45.43 
 
 		 418 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  39.64 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  47.04 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  44.04 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  49.28 
 
 		 316 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  31.72 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  41.41 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  42.55 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  38.7 
 
 		 436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  37.93 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  44.19 
 
 		 323 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  38.16 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  38.16 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  38.16 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  37.59 
 
 		 501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  38.16 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  38.16 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  42.61 
 
 		 292 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  37.24 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  36.9 
 
 		 501 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  36.9 
 
 		 501 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  41.43 
 
 		 288 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  43.45 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  33.79 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  37.71 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  44.61 
 
 		 481 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  32.53 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  46.76 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  38.31 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  42.92 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  41.35 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  40.94 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  40.89 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  35.66 
 
 		 311 aa  126  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  31.34 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40.43 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  33.44 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  34.26 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.21 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  36.21 
 
 		 781 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  33.97 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.96 
 
 		 274 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  34.93 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  34.07 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  34.83 
 
 		 356 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  34.56 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  33.69 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  33.52 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  31.8 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  33.52 
 
 		 330 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  33.52 
 
 		 330 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  33.52 
 
 		 330 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33 
 
 		 334 aa  86.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.12 
 
 		 290 aa  86.3  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  31.02 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  28.92 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  31.51 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.96 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  36.4 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.71 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  31.55 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  31.87 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  32.02 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.01 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.7 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  31.87 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  31.87 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  31.87 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  31.87 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  31.34 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  31.87 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  31.87 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  33.8 
 
 		 300 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  30.81 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  31.02 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.32 
 
 		 339 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.78 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  33.72 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  31.55 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.87 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.69 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.89 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.04 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.7 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.7 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.58 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.32 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  32.58 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  28.67 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  31.02 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  31.41 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>