More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4143 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  75 
 
 		 461 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  100 
 
 		 481 aa  954    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  46.94 
 
 		 461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  49.28 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  36.41 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  33.19 
 
 		 439 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  33.1 
 
 		 439 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  33.1 
 
 		 439 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  33.18 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  31.64 
 
 		 436 aa  179  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  33.18 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  35.16 
 
 		 301 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  36.49 
 
 		 501 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  41.26 
 
 		 410 aa  170  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  44.1 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  36.21 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  43.75 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  31.12 
 
 		 450 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  44.1 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  40.15 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  36.21 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  45.79 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  44.61 
 
 		 416 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  34.43 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  33.44 
 
 		 501 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  33.44 
 
 		 501 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  36.07 
 
 		 463 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  44.5 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  44.5 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  43.58 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  44.5 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  43.58 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  44.86 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  41.49 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  33.75 
 
 		 306 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  40.57 
 
 		 383 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  38.25 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  34.81 
 
 		 293 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  32.12 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  31.21 
 
 		 288 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  34.96 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  31.56 
 
 		 292 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40.17 
 
 		 302 aa  117  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  35.81 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  33.05 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  31.08 
 
 		 781 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.64 
 
 		 298 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  33.33 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.09 
 
 		 299 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.66 
 
 		 274 aa  93.2  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.18 
 
 		 339 aa  93.2  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 		 297 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.97 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.91 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.71 
 
 		 296 aa  93.2  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.84 
 
 		 357 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.11 
 
 		 371 aa  91.3  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.57 
 
 		 299 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  33.51 
 
 		 340 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  31.32 
 
 		 331 aa  88.6  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.71 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.51 
 
 		 335 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  31.63 
 
 		 301 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  30.73 
 
 		 280 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  31.32 
 
 		 331 aa  88.6  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.5 
 
 		 295 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 		 282 aa  87  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.08 
 
 		 324 aa  86.7  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.09 
 
 		 334 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.12 
 
 		 324 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.85 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  31.44 
 
 		 336 aa  86.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.5 
 
 		 331 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.85 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.73 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.47 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  28.88 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  30.77 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.32 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  31.33 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.23 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 831 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.43 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.43 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.22 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.39 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  32.12 
 
 		 618 aa  83.6  0.000000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.22 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.94 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  31.89 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  32.43 
 
 		 316 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 307 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0781  protease IV, putative  32.97 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  36.16 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  32.56 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  28.96 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  32.14 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  31.56 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  32.4 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.92 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>