More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2225 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  100 
 
 		 436 aa  888    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  55.39 
 
 		 439 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  55.39 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  55.64 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  55.39 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  55.64 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  50.13 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  43.72 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  49.16 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  49.4 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  48.92 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  48.8 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  48.8 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  41.84 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  41.22 
 
 		 288 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  43.01 
 
 		 448 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  34.13 
 
 		 445 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  34.45 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  43.01 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  37.02 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  43.01 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  38.38 
 
 		 301 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  37.85 
 
 		 436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  37.2 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  36.97 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  36.71 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  39.07 
 
 		 392 aa  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  38.65 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  32.37 
 
 		 481 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  38.83 
 
 		 416 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  35.06 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  43.6 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  37.73 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  43.6 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  34.12 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  38.74 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  35.71 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  35.66 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  37.8 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  39.91 
 
 		 323 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  49.43 
 
 		 201 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  33.55 
 
 		 374 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  36.95 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  28.06 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  35.75 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  34.22 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  35.41 
 
 		 302 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  30.17 
 
 		 781 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.06 
 
 		 311 aa  93.6  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  33.49 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.41 
 
 		 339 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.3 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.69 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.69 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  34.72 
 
 		 289 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  31.69 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  30.41 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  31.73 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  31.73 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.69 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  31.03 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.26 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  32.63 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  31.4 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.68 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  31.79 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  33.52 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.7 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.7 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.76 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.02 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.7 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.5 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  31.61 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  32.91 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  29.59 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.18 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.09 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.49 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  35.23 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  31.43 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.17 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.67 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  29.82 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  31.67 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.85 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.88 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  30.6 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  31.79 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.19 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.41 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  32.39 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.33 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  34.42 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.03 
 
 		 339 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.27 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.97 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  27.57 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  25.65 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>