19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00735 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  100 
 
 
439 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  98.01 
 
 
439 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  98.01 
 
 
439 aa  387  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  98.01 
 
 
439 aa  387  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  48.86 
 
 
436 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  41.48 
 
 
498 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  42.31 
 
 
501 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  42.31 
 
 
501 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  41.67 
 
 
501 aa  104  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  41.67 
 
 
501 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  41.67 
 
 
501 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  36.08 
 
 
450 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  33.53 
 
 
481 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  33.52 
 
 
461 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  40.91 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  26.99 
 
 
445 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  42.55 
 
 
416 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0571682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>