More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1786 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_10039  capsid component  97.95 
 
 
439 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  100 
 
 
439 aa  885    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  97.95 
 
 
439 aa  865    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  100 
 
 
439 aa  885    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  98.18 
 
 
439 aa  867    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  55.39 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  53.24 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  53.24 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  53.25 
 
 
501 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  53.01 
 
 
501 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  52.53 
 
 
501 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  98.01 
 
 
201 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  51.34 
 
 
498 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  45.79 
 
 
450 aa  359  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  38.23 
 
 
293 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  36.43 
 
 
288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  35.6 
 
 
461 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  40.96 
 
 
448 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  41.33 
 
 
448 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  36.55 
 
 
441 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  34.62 
 
 
301 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  40.96 
 
 
451 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  36.3 
 
 
292 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  32.75 
 
 
481 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  38.16 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  35.93 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  37.24 
 
 
408 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  34.65 
 
 
316 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  36.33 
 
 
461 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  31.28 
 
 
445 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  35.37 
 
 
410 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  35.02 
 
 
433 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  35.23 
 
 
433 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  41.15 
 
 
418 aa  156  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  40.81 
 
 
418 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  33.02 
 
 
323 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  41.71 
 
 
392 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  36.05 
 
 
323 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  32.23 
 
 
306 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  32.05 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  34.43 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  37.37 
 
 
353 aa  137  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  35.39 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  36.51 
 
 
311 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  29.17 
 
 
463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  32.72 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  31.72 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  34.47 
 
 
302 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  34.1 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  25.94 
 
 
781 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.22 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.99 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.46 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  29.65 
 
 
320 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.79 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.98 
 
 
298 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.15 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.09 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  31.03 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  28.15 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  31.4 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.77 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.24 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.11 
 
 
547 aa  80.1  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  29.59 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  29.13 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  27.97 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  28.19 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  28.19 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.67 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.84 
 
 
327 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.76 
 
 
326 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  31.21 
 
 
288 aa  76.3  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.78 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  28.93 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.66 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.38 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  36.84 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  29.44 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  29.11 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.04 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  29.5 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  31.07 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  30.68 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  29.5 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.5 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.5 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.2 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.49 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.11 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.56 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.45 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.23 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  27.46 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  25.94 
 
 
288 aa  72.8  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  27.5 
 
 
316 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.7 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.64 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>