More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1752 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  100 
 
 		 314 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  66.98 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  45.1 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  45.25 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  44.2 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  34.29 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  37.29 
 
 		 781 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  39.07 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  38.21 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  36.1 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  33.19 
 
 		 410 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  36.74 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  36.28 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  34.2 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  40.72 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  35.24 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  34.88 
 
 		 433 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  29.86 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  34.88 
 
 		 418 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  33.33 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  32.47 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  33.49 
 
 		 445 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1336  peptidase S49  31.31 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  28.24 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  29.6 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  29.6 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  29.24 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  28.77 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  28.77 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  28.77 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  33.02 
 
 		 441 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  28.77 
 
 		 501 aa  79  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  33.96 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  28.42 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.8 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  34.56 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  30.37 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  25.65 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  23.57 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  29.11 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  29.11 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  36.67 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  33.18 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  36.67 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  27.4 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  36.11 
 
 		 448 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  29.27 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  30.48 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  30.28 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  26.57 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  28.44 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  36.84 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  28.24 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  30.89 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.02 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.89 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  26.7 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.86 
 
 		 593 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.86 
 
 		 593 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.78 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  28.5 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  28.77 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  28.5 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  31.63 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  28.5 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  33.15 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.14 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  31.44 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  28.5 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  31.34 
 
 		 623 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.53 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  33.18 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.11 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  27.55 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  28.19 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  28.95 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.83 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.89 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.58 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  28.73 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  28.37 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  29.03 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  28.39 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  28.73 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  28.73 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.55 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  28.73 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  28.73 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  26.7 
 
 		 618 aa  61.2  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  28.73 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  28.73 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  28.39 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  28.73 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  30.1 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  27.88 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  26.5 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  28.75 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  27.88 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  26.5 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  26.92 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>