More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1694 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  100 
 
 		 343 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  85.71 
 
 		 343 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  85.67 
 
 		 342 aa  578  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  79.53 
 
 		 338 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  82.51 
 
 		 343 aa  540  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  74.71 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  79.53 
 
 		 338 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  72.81 
 
 		 336 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  78.65 
 
 		 338 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  79.53 
 
 		 338 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  79.24 
 
 		 338 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  79.04 
 
 		 330 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  79.53 
 
 		 338 aa  522  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  79.53 
 
 		 338 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  79.24 
 
 		 338 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  72.22 
 
 		 337 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  58.84 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  57.59 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  56.82 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  57.83 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  57.31 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  51.16 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  53.96 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  51.16 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  51.16 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  56.73 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  53.85 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  55.07 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  55.07 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  51.59 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  53.35 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  55.07 
 
 		 349 aa  359  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  55.07 
 
 		 349 aa  359  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  55.07 
 
 		 349 aa  359  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  55.07 
 
 		 349 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  54.78 
 
 		 349 aa  358  9e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  54.2 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  54.2 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  54.2 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  54.2 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  54.83 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  53.91 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  54.78 
 
 		 349 aa  355  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  53.2 
 
 		 347 aa  355  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  51.85 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  50.44 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  50.46 
 
 		 334 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  50.61 
 
 		 339 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  50.76 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  50.61 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  51.04 
 
 		 340 aa  331  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  50.46 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  46.81 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  51.66 
 
 		 347 aa  322  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  46.46 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  47.92 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  48.51 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  47.62 
 
 		 338 aa  318  9e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  48.95 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  47.77 
 
 		 340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  48.65 
 
 		 341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  43.67 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  47.45 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  47.45 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  45.29 
 
 		 342 aa  308  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  50.31 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  47.51 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  50 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  46 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  60 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  51.96 
 
 		 324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  47.8 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  52.65 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  45 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  48.15 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  45.68 
 
 		 312 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  42.99 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  50 
 
 		 216 aa  195  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  46.76 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  43.64 
 
 		 165 aa  129  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  35.1 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  34.69 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  34.58 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.49 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.2 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  33.88 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  40.32 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.17 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.2 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.74 
 
 		 547 aa  97.1  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  37.24 
 
 		 286 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  33.96 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  33.82 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  32.91 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.58 
 
 		 625 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  32.11 
 
 		 609 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  32.91 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  32.64 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>