More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1530 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  100 
 
 
353 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  53.56 
 
 
339 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  52.99 
 
 
339 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  53.28 
 
 
339 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  52.71 
 
 
339 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  51.14 
 
 
340 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  52.79 
 
 
365 aa  358  9e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  52.69 
 
 
342 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  53.49 
 
 
348 aa  351  8.999999999999999e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  53.55 
 
 
348 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  54.26 
 
 
341 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  51.32 
 
 
353 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  53.98 
 
 
341 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  50.85 
 
 
340 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  53.66 
 
 
348 aa  345  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  51.94 
 
 
348 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  51.94 
 
 
348 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  51.94 
 
 
348 aa  345  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  53.98 
 
 
339 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  54.27 
 
 
348 aa  344  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  46.59 
 
 
343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  51.7 
 
 
349 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  53.25 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  53.69 
 
 
347 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  46.26 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  50.57 
 
 
340 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  45.45 
 
 
336 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  50.14 
 
 
340 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  48.6 
 
 
353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  46.63 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  47.59 
 
 
342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  49.11 
 
 
337 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  48.21 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  47.14 
 
 
349 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  46.46 
 
 
343 aa  323  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  54.17 
 
 
349 aa  322  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  50.71 
 
 
343 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  50.15 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  47.62 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  48.21 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  45.85 
 
 
338 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  45.56 
 
 
338 aa  315  5e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  46.2 
 
 
334 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  49.85 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  49.85 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  52.82 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  52.82 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  52.82 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  52.82 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  52.92 
 
 
347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  52.52 
 
 
348 aa  311  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  49.55 
 
 
349 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  49.3 
 
 
353 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  49.55 
 
 
349 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  46.8 
 
 
353 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  47.92 
 
 
338 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  47.92 
 
 
338 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  47.92 
 
 
338 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  47.25 
 
 
344 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  47.62 
 
 
338 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  46.95 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  46.61 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  47.32 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  51.72 
 
 
324 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  46.49 
 
 
333 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  59.23 
 
 
332 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  58.65 
 
 
326 aa  292  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  50.65 
 
 
312 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  47.14 
 
 
347 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  44.15 
 
 
334 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  43.71 
 
 
335 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  44.15 
 
 
334 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  47.87 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  44.35 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  50.86 
 
 
234 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  52.31 
 
 
216 aa  199  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  43.03 
 
 
165 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  33.18 
 
 
286 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.03 
 
 
596 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  33.64 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  30.32 
 
 
609 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  31.19 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.02 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  32.24 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  39.29 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  30.99 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.8 
 
 
596 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  30.85 
 
 
269 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.12 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  33.94 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  32.32 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.58 
 
 
313 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.68 
 
 
834 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  31.82 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.79 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  30.49 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>