More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2570 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  100 
 
 		 336 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  77.31 
 
 		 337 aa  552  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  72.22 
 
 		 343 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  77.81 
 
 		 338 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  72.51 
 
 		 343 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  75.07 
 
 		 342 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  78.11 
 
 		 338 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  77.51 
 
 		 338 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  75.44 
 
 		 338 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  77.81 
 
 		 338 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  73.96 
 
 		 338 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  69.05 
 
 		 337 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  75.74 
 
 		 338 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  75.44 
 
 		 338 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  75.15 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  73.68 
 
 		 343 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  56.98 
 
 		 349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  54.73 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  55.76 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  50.44 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  57.83 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  49.42 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  52.46 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  52.46 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  55.01 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  52.46 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  52.46 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  52.46 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  52.46 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  52.66 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  52.17 
 
 		 349 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  50 
 
 		 348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  49 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  52.17 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  54.39 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  53.91 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  53.91 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  53.91 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  53.91 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  53.62 
 
 		 348 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  49.71 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  52.29 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  50.31 
 
 		 339 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  50 
 
 		 339 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  50.61 
 
 		 339 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  50.31 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  50.15 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  48.25 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  49.4 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  48.79 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  48.48 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  44.92 
 
 		 353 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  48.96 
 
 		 340 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  45.28 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  48.65 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  50 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  46.55 
 
 		 342 aa  312  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  47.4 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  47.09 
 
 		 341 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  48.4 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  49.54 
 
 		 339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  49.68 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  49.68 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  51.06 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  56.78 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  42.86 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  44.51 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  45.86 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  48.19 
 
 		 347 aa  291  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  56.78 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  44.48 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  45.54 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  45.54 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  42.22 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  47.87 
 
 		 234 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  48.37 
 
 		 216 aa  190  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  43.03 
 
 		 165 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  30.58 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  30.17 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  30.17 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.79 
 
 		 625 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  30.92 
 
 		 552 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  38.71 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  29.05 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  28.38 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  31.28 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  30.49 
 
 		 609 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  37.9 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  29.85 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  31.28 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.11 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  37.9 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  29.85 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  31.28 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  31.28 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  31.28 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>