More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1193 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  100 
 
 		 349 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  60.92 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  59.03 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  57.56 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  58.62 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  60 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  58.26 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  60.29 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  58.55 
 
 		 348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  61.03 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  56.81 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  60.74 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  57.1 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  56.13 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  61.21 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  56.13 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  61.45 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  56.13 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  60.12 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  58.55 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  60 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  56.81 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  58.26 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  58.26 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  59.3 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  59.3 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  60.46 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  58.86 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  56.2 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  59.64 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  55.52 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  54.02 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  56.85 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  56.85 
 
 		 349 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  56.85 
 
 		 349 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  56.85 
 
 		 349 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  55.46 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  56.56 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  56.56 
 
 		 349 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  56.56 
 
 		 349 aa  360  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  56.56 
 
 		 349 aa  359  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  53.85 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  52.21 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  53.87 
 
 		 339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  53.87 
 
 		 339 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  53.57 
 
 		 339 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  55.69 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  55.69 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  55.69 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  55.69 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  55.39 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  53.62 
 
 		 347 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  52.75 
 
 		 353 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  52.72 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  52.03 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  51.86 
 
 		 340 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  52.15 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  50.29 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 347 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  50.29 
 
 		 341 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  46.94 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  46.65 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  47.77 
 
 		 325 aa  318  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  45.11 
 
 		 334 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  47.58 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  44.66 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  50.72 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  48.09 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  46.73 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  46.73 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  51.82 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  50.99 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  53.26 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  51.5 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  51.5 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  51.99 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  52.82 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  40 
 
 		 335 aa  269  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  53.92 
 
 		 234 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  48.37 
 
 		 216 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  41.21 
 
 		 165 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.91 
 
 		 625 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  37.5 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  33.82 
 
 		 286 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  31.25 
 
 		 297 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  35.79 
 
 		 283 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  30.9 
 
 		 364 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  32.85 
 
 		 286 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  33.66 
 
 		 286 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  35.1 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  31.18 
 
 		 552 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  30.9 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  34.62 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  29.13 
 
 		 312 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  37.23 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  32.18 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  30.08 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  31.03 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  28.7 
 
 		 609 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  28.97 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>