More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1430 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  99.71 
 
 
348 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  100 
 
 
348 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  100 
 
 
348 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  100 
 
 
348 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  100 
 
 
348 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  87.68 
 
 
349 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  87.68 
 
 
349 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  87.68 
 
 
349 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  87.68 
 
 
349 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  87.39 
 
 
349 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  87.68 
 
 
349 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  87.39 
 
 
349 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  87.11 
 
 
349 aa  567  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  79.6 
 
 
347 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  67.05 
 
 
348 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  67.91 
 
 
348 aa  474  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  66.76 
 
 
348 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  67.44 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  64.47 
 
 
348 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  64.47 
 
 
348 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  64.47 
 
 
348 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  65.62 
 
 
348 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  54.02 
 
 
343 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  56.9 
 
 
337 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  55.37 
 
 
353 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  54.2 
 
 
336 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  54.49 
 
 
343 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  53.8 
 
 
353 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  58.91 
 
 
343 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  57.18 
 
 
338 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  55.36 
 
 
349 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  54.89 
 
 
338 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  56.03 
 
 
338 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  55.46 
 
 
342 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  53.94 
 
 
337 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  54.44 
 
 
349 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  54.65 
 
 
347 aa  363  2e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  56.61 
 
 
338 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  54.49 
 
 
338 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  57.23 
 
 
330 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  53.54 
 
 
353 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  54.6 
 
 
338 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  56.61 
 
 
338 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  55.07 
 
 
338 aa  358  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  54.39 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  52.33 
 
 
340 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  53.04 
 
 
344 aa  349  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  49.58 
 
 
365 aa  348  7e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  50.72 
 
 
340 aa  342  5.999999999999999e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  50 
 
 
339 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  53.98 
 
 
347 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  52.82 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  49.71 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  49.13 
 
 
339 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  48.84 
 
 
339 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  52.33 
 
 
342 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  51.03 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  48.18 
 
 
356 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  50.29 
 
 
340 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  48.52 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  48.52 
 
 
338 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  51.16 
 
 
341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  50 
 
 
340 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  50.29 
 
 
341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  50.44 
 
 
339 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  51.31 
 
 
347 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  48.08 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  51.45 
 
 
349 aa  301  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  48.34 
 
 
333 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  47.49 
 
 
312 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  49.24 
 
 
335 aa  296  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  47.37 
 
 
334 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  47.37 
 
 
334 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  48.48 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  49.83 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  44.51 
 
 
325 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  56.47 
 
 
326 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  52.61 
 
 
332 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  52.78 
 
 
216 aa  212  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  48.87 
 
 
234 aa  196  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  40.85 
 
 
165 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  33.18 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  35.44 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  34.07 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  30.94 
 
 
552 aa  95.1  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  33.82 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  33.5 
 
 
286 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  31.14 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  30.7 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  33.96 
 
 
293 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  33.17 
 
 
278 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  32.46 
 
 
287 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  31.05 
 
 
378 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.53 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.96 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.13 
 
 
584 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  33.96 
 
 
269 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  31.05 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  31.05 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  31.05 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>