More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2728 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  100 
 
 		 340 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  97.06 
 
 		 340 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  84.12 
 
 		 340 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  79.35 
 
 		 339 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  79.65 
 
 		 339 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  79.35 
 
 		 339 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  78.17 
 
 		 339 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  74.41 
 
 		 341 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  74.12 
 
 		 341 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  75.88 
 
 		 339 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  69.62 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  52.37 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  48.21 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  52.94 
 
 		 337 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  51.6 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  51.03 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  51.12 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  48.65 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  48.97 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  50.29 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  52.58 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  48.07 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  51.88 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  51.88 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  51.88 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  51.62 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  51.84 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  51.53 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  48.98 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  48.81 
 
 		 337 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  50.75 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  47.83 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  50.74 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  49.85 
 
 		 348 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  51.03 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  51.45 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  51.45 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  47.81 
 
 		 340 aa  319  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  51.45 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  51.47 
 
 		 338 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  51.16 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  50.14 
 
 		 353 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  48.32 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  50.29 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  47.69 
 
 		 348 aa  316  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  47.98 
 
 		 348 aa  315  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  50.86 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  50.87 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  51.52 
 
 		 338 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  53.05 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  58.74 
 
 		 349 aa  311  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  51.02 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  46.75 
 
 		 356 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  53.12 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  50.91 
 
 		 338 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  50.61 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  49.42 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  51.71 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  51.37 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  51.37 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  49.42 
 
 		 348 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  49.42 
 
 		 348 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  49.42 
 
 		 348 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  49.42 
 
 		 348 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  49.13 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  49.52 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  48.25 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  58.19 
 
 		 326 aa  296  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  51.89 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  45.99 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  46.9 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  52.81 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  52.81 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  45.82 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  55.56 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  50.23 
 
 		 234 aa  205  9e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  47.22 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  43.03 
 
 		 165 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.98 
 
 		 547 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  34.17 
 
 		 611 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.35 
 
 		 596 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.68 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.68 
 
 		 595 aa  90.1  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.48 
 
 		 596 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.44 
 
 		 625 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  37.65 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.94 
 
 		 590 aa  87.8  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  31.79 
 
 		 269 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  31.16 
 
 		 633 aa  86.7  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  34.1 
 
 		 601 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.98 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  28.51 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  31.03 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 		 656 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  32.06 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  30.96 
 
 		 601 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>