More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2353 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  100 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  79.15 
 
 		 293 aa  434  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  78.32 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  74.02 
 
 		 302 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  74.82 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  76.51 
 
 		 299 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  74.29 
 
 		 300 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  58.95 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  54.9 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  58.95 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  58.25 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  54.64 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  54.64 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  53.31 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  53.74 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  56.74 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  53.12 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  59.3 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  52.63 
 
 		 283 aa  278  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  57.54 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  51.9 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  52.94 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  60.08 
 
 		 285 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  49.48 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  49.12 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  51.16 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  49.82 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  49.82 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  51.66 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  47 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  47.35 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  46.89 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  45.94 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  48.33 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  55.71 
 
 		 306 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  46.01 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.51 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  49.2 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  47.44 
 
 		 394 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  45.92 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  43.81 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.18 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  46.67 
 
 		 364 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  47.2 
 
 		 364 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.38 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  38.8 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  39.38 
 
 		 313 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  47.37 
 
 		 378 aa  168  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.81 
 
 		 339 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  45.58 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.27 
 
 		 350 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.84 
 
 		 326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  48.09 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.26 
 
 		 329 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.26 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.26 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.7 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  46.84 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  46.99 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  47.54 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  43.06 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  40.55 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  44.08 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  41.01 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  46.99 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  46.99 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  47.25 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  46.99 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  47.62 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  44.08 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  44.08 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  44.08 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  44.08 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  44.08 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  44.08 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  44.08 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  40.09 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.36 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  43.64 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  39.56 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1966  peptidase S49  48 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  44.32 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  47.8 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  47.95 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  47.95 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  43.38 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  43.92 
 
 		 327 aa  158  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  42.92 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  37.83 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  44.97 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  45.6 
 
 		 356 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2055  peptidase S49  43.97 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.360179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  44.15 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  38.65 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  40.47 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  41.55 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  45.26 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  45.16 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  42.63 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  44.34 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>