More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1356 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  100 
 
 
311 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  54 
 
 
313 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  52.84 
 
 
312 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  51.82 
 
 
316 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  53.18 
 
 
326 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  53.06 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  51.95 
 
 
326 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  51.96 
 
 
329 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  51.6 
 
 
321 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  50.46 
 
 
325 aa  321  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.79 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.13 
 
 
332 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  52.46 
 
 
332 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.04 
 
 
329 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.38 
 
 
329 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  51.49 
 
 
325 aa  316  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.99 
 
 
329 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  47.27 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  50 
 
 
320 aa  305  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  50.17 
 
 
349 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  49.67 
 
 
394 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  48.49 
 
 
364 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  48.49 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  50.5 
 
 
311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  49.66 
 
 
378 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  48.49 
 
 
330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  48.49 
 
 
330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  47.68 
 
 
330 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  48.49 
 
 
330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  48.7 
 
 
361 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  46.93 
 
 
350 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  49.49 
 
 
360 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  49.49 
 
 
329 aa  292  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  47.83 
 
 
330 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  49.49 
 
 
333 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  49.68 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  46.73 
 
 
321 aa  288  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  47.77 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  47.95 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  47.95 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  47.95 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  47.95 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  47.95 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  47.16 
 
 
330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  47.95 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  48.46 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  46.98 
 
 
347 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0822  peptidase S49  48.24 
 
 
336 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  46.41 
 
 
323 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  46.82 
 
 
330 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  50.17 
 
 
334 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  48.06 
 
 
347 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  47.19 
 
 
340 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  48.3 
 
 
348 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  47.74 
 
 
347 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.9 
 
 
350 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.21 
 
 
350 aa  272  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  48.11 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  44.92 
 
 
313 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  49.83 
 
 
334 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  46.02 
 
 
318 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  46.02 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  43.69 
 
 
315 aa  251  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  50.64 
 
 
336 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.21 
 
 
357 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  50.6 
 
 
316 aa  248  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  43.88 
 
 
351 aa  242  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.54 
 
 
351 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  42.56 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.19 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.95 
 
 
339 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.31 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  35.31 
 
 
313 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  45.11 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  44.58 
 
 
267 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  47.03 
 
 
302 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  46.88 
 
 
265 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  43.81 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  48.02 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  43.05 
 
 
295 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  45.63 
 
 
293 aa  168  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  43.22 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  48.06 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  41.3 
 
 
300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  41.74 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  50.28 
 
 
288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  40.36 
 
 
297 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  42.13 
 
 
265 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  38.91 
 
 
265 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  47.09 
 
 
290 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  46.03 
 
 
368 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  42.4 
 
 
283 aa  159  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  46.03 
 
 
368 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  49.44 
 
 
292 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  40.59 
 
 
265 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  40.59 
 
 
265 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  41.96 
 
 
287 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  40 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  46.12 
 
 
299 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  43.2 
 
 
287 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>