More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0947 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  100 
 
 		 288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  71.88 
 
 		 288 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  70.79 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  69.79 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  66.55 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  65.17 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  65.17 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  62.32 
 
 		 286 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  59.38 
 
 		 283 aa  344  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  53.74 
 
 		 295 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  51.4 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  50.68 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  51.05 
 
 		 302 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  51.94 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  50.53 
 
 		 286 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  49.12 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  49.12 
 
 		 286 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  49.48 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  50.87 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  51.25 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  51.06 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  50.69 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  48.21 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  55.79 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  50.68 
 
 		 299 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  47 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  48.2 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  46.32 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  45.58 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  47.83 
 
 		 265 aa  228  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  46.29 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  46.29 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  47.27 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  48.72 
 
 		 290 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  50.21 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2055  peptidase S49  47.27 
 
 		 264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.360179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  52.84 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  47.09 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  51.98 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.21 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  49.76 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  50.26 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  48.77 
 
 		 387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  42.44 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  48.76 
 
 		 364 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  48.76 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  48.95 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  52.57 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.69 
 
 		 326 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  47.57 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  52.25 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  47.42 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  46.73 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  42.79 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.79 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  48.45 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  48.45 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  49.19 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  45.28 
 
 		 360 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  47.29 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  45.45 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  47.29 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  47.29 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  48.92 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  47.29 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  47.78 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  48.91 
 
 		 333 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.55 
 
 		 329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.55 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  48.42 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  48.91 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  48.91 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  48.91 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  48.91 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  48.91 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  48.91 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  48.91 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.55 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  47.4 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.94 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.69 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.37 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  43.81 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  44.55 
 
 		 321 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  48.88 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  52.44 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  52.44 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  48.65 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  46.15 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  47.09 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  47.12 
 
 		 336 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  50.28 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  43.26 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  43.66 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  46.01 
 
 		 348 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.52 
 
 		 339 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  49.46 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  49.46 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  44.39 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>