More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1565 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 350 aa  721    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.97 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.68 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.68 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  45.3 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  48.81 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.51 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.7 
 
 		 329 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  48.81 
 
 		 364 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  50.17 
 
 		 332 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  46.67 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  48.97 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  48.65 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.69 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  47.67 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  47.73 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  44.51 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  46.44 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  45.51 
 
 		 347 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  47.4 
 
 		 326 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  44.98 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  45.18 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  46.84 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  46.15 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  46.18 
 
 		 394 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  45.92 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  45.21 
 
 		 311 aa  265  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  45.51 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  42.69 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  44.71 
 
 		 327 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  46.23 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  45.18 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  45.18 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  45.18 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  44.16 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  44.05 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  41.64 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  44.19 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  41.35 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  44.82 
 
 		 321 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  48.45 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  44.56 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  47.22 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  46.27 
 
 		 347 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.19 
 
 		 350 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  45.13 
 
 		 329 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  48.45 
 
 		 336 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  43.88 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  44.74 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.16 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  45.26 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  44.91 
 
 		 333 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  46.96 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  45.12 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  44.91 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  44.91 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  44.91 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  44.91 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  44.91 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  44.52 
 
 		 313 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0822  peptidase S49  43.75 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  46.53 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  46.98 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  41.78 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  44.93 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  41.78 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  47.11 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.86 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  38.79 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.79 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.62 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  48.15 
 
 		 302 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.53 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  40.15 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  48.8 
 
 		 300 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  46.51 
 
 		 283 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  48.29 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  47.2 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  44.55 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  45.93 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  44.39 
 
 		 300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  48.37 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  40.82 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  44.26 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  44.26 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  45.12 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  45.37 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  43.18 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  43.4 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  43.18 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  41.2 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  42.73 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  41.55 
 
 		 283 aa  170  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  46.8 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  43.15 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  43.2 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  44.19 
 
 		 287 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  46.98 
 
 		 299 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  42.44 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  43.14 
 
 		 265 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>