More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0104 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  100 
 
 		 461 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  47.18 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  46.44 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  53.8 
 
 		 374 aa  259  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  46.24 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  43.73 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  43.88 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  48.13 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  44.48 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  48.13 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  47.76 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  43.32 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  43.17 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  37.59 
 
 		 301 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  44.04 
 
 		 416 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  37.02 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  42.86 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  43.52 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  43.24 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  36.46 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  38.57 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  38.93 
 
 		 501 aa  170  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  37.46 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  30.71 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  42.86 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  38.57 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  38.21 
 
 		 501 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  38.21 
 
 		 501 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  39.56 
 
 		 383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  34.5 
 
 		 439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  34.5 
 
 		 439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  45.45 
 
 		 323 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  36.33 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  34.42 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  36.33 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  37.63 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  32.69 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  42.12 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  38.71 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  35.56 
 
 		 292 aa  143  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  36.49 
 
 		 293 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  33.8 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  40.8 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  34.05 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  36.44 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  39.8 
 
 		 781 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  39.79 
 
 		 331 aa  113  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  39.79 
 
 		 331 aa  113  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  38.14 
 
 		 327 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  37.44 
 
 		 336 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.71 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.27 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.1 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  37.45 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.5 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.21 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.55 
 
 		 299 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  38.89 
 
 		 360 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.41 
 
 		 298 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  33.33 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.92 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.15 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  37.02 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  36.36 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  35.05 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.47 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.82 
 
 		 274 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  35.24 
 
 		 314 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.47 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  36.51 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.08 
 
 		 357 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  33.33 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  36.51 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  37.22 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.84 
 
 		 321 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  34.05 
 
 		 340 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.71 
 
 		 382 aa  97.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.32 
 
 		 321 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  35.56 
 
 		 356 aa  97.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.17 
 
 		 335 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  33.16 
 
 		 580 aa  96.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  35.94 
 
 		 283 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.02 
 
 		 831 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.78 
 
 		 324 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  31.94 
 
 		 316 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.81 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  32.8 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 307 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.7 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.8 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.46 
 
 		 260 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.57 
 
 		 319 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  32.63 
 
 		 321 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.59 
 
 		 331 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  33.33 
 
 		 290 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.96 
 
 		 296 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  34.54 
 
 		 347 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.93 
 
 		 322 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  30.69 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.13 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>