More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3206 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  100 
 
 		 441 aa  874    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  66.51 
 
 		 416 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  70.75 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  41.87 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  41.87 
 
 		 410 aa  293  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  41.52 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  41.19 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  41.8 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  41.9 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  41.12 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  55 
 
 		 353 aa  220  3.9999999999999997e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  45.04 
 
 		 383 aa  200  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  47.81 
 
 		 316 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  42.66 
 
 		 293 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  42.96 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  44.48 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  42.72 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  41.13 
 
 		 445 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  43.89 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  36.86 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  36.55 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  39.58 
 
 		 288 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  34.53 
 
 		 501 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  33.67 
 
 		 498 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  36.55 
 
 		 439 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  36.55 
 
 		 439 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  33.93 
 
 		 501 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  33.93 
 
 		 501 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  34.23 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  35.86 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  35.86 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  35.86 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  41.05 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  31.18 
 
 		 450 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  37.81 
 
 		 301 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  44.26 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  44.58 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  40.21 
 
 		 323 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  45.79 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  32.56 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  39.45 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  39.41 
 
 		 448 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  34.36 
 
 		 311 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  39.03 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  39.73 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  35.85 
 
 		 321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  33.55 
 
 		 781 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  35.55 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.99 
 
 		 274 aa  96.7  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.85 
 
 		 376 aa  91.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  32.72 
 
 		 300 aa  90.1  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31 
 
 		 605 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.34 
 
 		 311 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31 
 
 		 605 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.97 
 
 		 339 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.6 
 
 		 334 aa  87.8  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  32.09 
 
 		 378 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  28.09 
 
 		 402 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  31.34 
 
 		 364 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  35.62 
 
 		 300 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  30.88 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32.41 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  31.63 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.02 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.69 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  30.05 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.78 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.66 
 
 		 297 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.39 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.57 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  22.03 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  29.41 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  36.53 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  33.7 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  31.35 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  35.33 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.31 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.02 
 
 		 831 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  33.52 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  32.62 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  33.02 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 326 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.32 
 
 		 383 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.22 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  29.26 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  32.93 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  31.16 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.9 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  32.09 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  32.97 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.19 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.18 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  29.58 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  32.97 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  32.97 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.14 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  31.69 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.98 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.5 
 
 		 875 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.18 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>