More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1261 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  100 
 
 		 522 aa  1039    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  63.88 
 
 		 550 aa  655    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1397  peptidase S49  64.24 
 
 		 550 aa  655    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  63.6 
 
 		 552 aa  629  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  49.4 
 
 		 612 aa  432  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.79 
 
 		 327 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0198  peptidase S49  39.32 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  36.9 
 
 		 332 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2635  peptidase S49  34.6 
 
 		 328 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.194824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  33.16 
 
 		 326 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.29 
 
 		 332 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.29 
 
 		 348 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  33.16 
 
 		 326 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.61 
 
 		 354 aa  94.4  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  35.12 
 
 		 351 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  34.39 
 
 		 329 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.61 
 
 		 351 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  32.43 
 
 		 618 aa  91.7  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 		 584 aa  91.3  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.31 
 
 		 296 aa  91.3  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 342 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  37.7 
 
 		 329 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  36.81 
 
 		 349 aa  90.9  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  34.76 
 
 		 333 aa  90.1  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  33.04 
 
 		 316 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  31.82 
 
 		 301 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  36 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.52 
 
 		 260 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.19 
 
 		 350 aa  88.2  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.08 
 
 		 295 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  34.98 
 
 		 387 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  33.51 
 
 		 333 aa  87  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  33.51 
 
 		 333 aa  86.7  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.02 
 
 		 296 aa  86.7  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  33.51 
 
 		 333 aa  86.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  33.51 
 
 		 333 aa  86.7  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  27.14 
 
 		 552 aa  86.7  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  33.51 
 
 		 333 aa  86.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  32.92 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  33.51 
 
 		 333 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  33.51 
 
 		 333 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.99 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.16 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.48 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  27.42 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  33.71 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.54 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  32.99 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  32.43 
 
 		 616 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.79 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.79 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.46 
 
 		 616 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.2 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.2 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.41 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  34.08 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  32.03 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.47 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.42 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  34.55 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  36.79 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  33.33 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.25 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  35.9 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  29.67 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.07 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.52 
 
 		 357 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  33.33 
 
 		 330 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.32 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  28.51 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  33.51 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  29.91 
 
 		 616 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.99 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.86 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.16 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  30.24 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.81 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.37 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  29.78 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.82 
 
 		 625 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  31.91 
 
 		 618 aa  81.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  33.65 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  29.91 
 
 		 616 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  30.81 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  34.46 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.95 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  33.16 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  33.16 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  33.16 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.33 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.06 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.25 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  31.89 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  31.89 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.47 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26 
 
 		 547 aa  80.1  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.76 
 
 		 329 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  33.91 
 
 		 287 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.03 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>