More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0198 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0198  peptidase S49  100 
 
 
307 aa  594  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2635  peptidase S49  44 
 
 
328 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.194824  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  39.32 
 
 
522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  35.02 
 
 
608 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  35.89 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  38.65 
 
 
612 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.2 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  35.56 
 
 
340 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.71 
 
 
613 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1397  peptidase S49  33.33 
 
 
550 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.8 
 
 
282 aa  106  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  36.41 
 
 
552 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  36.29 
 
 
623 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.23 
 
 
338 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.63 
 
 
605 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  35.51 
 
 
612 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.79 
 
 
613 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.63 
 
 
366 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 
296 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.5 
 
 
613 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.15 
 
 
589 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.07 
 
 
563 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  35.24 
 
 
550 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35 
 
 
613 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.84 
 
 
327 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  34.62 
 
 
610 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.93 
 
 
290 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.69 
 
 
383 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.76 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.33 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.16 
 
 
587 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.45 
 
 
656 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.6 
 
 
831 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.68 
 
 
615 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  34.16 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  31.22 
 
 
297 aa  96.3  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.58 
 
 
617 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.15 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.45 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.29 
 
 
633 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.07 
 
 
566 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.42 
 
 
604 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.91 
 
 
319 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.72 
 
 
593 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.72 
 
 
593 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
649 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  35.29 
 
 
633 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.54 
 
 
617 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  34.83 
 
 
616 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.21 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.56 
 
 
614 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.27 
 
 
637 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  33.58 
 
 
583 aa  92.8  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 
590 aa  92.8  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.73 
 
 
596 aa  92.4  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.67 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.53 
 
 
588 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.1 
 
 
614 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  31.58 
 
 
618 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.1 
 
 
615 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  34.12 
 
 
617 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  31.74 
 
 
410 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.1 
 
 
615 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.82 
 
 
598 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.1 
 
 
615 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.1 
 
 
614 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.82 
 
 
598 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.02 
 
 
640 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  30.97 
 
 
616 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.48 
 
 
614 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.34 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  30.97 
 
 
616 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.11 
 
 
661 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  32.47 
 
 
583 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.7 
 
 
596 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  30.97 
 
 
616 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.5 
 
 
314 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.64 
 
 
625 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.98 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.74 
 
 
562 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.14 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  35.05 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.64 
 
 
615 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.34 
 
 
629 aa  89.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.21 
 
 
371 aa  89.4  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  30.86 
 
 
618 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  30.45 
 
 
618 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.71 
 
 
585 aa  89  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.67 
 
 
297 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  30.86 
 
 
616 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  30.45 
 
 
618 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  30.45 
 
 
618 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.8 
 
 
382 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.47 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.28 
 
 
593 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.22 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.8 
 
 
382 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  30.43 
 
 
611 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  30.45 
 
 
618 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>