More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0153 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  100 
 
 		 612 aa  1222    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1397  peptidase S49  55.13 
 
 		 550 aa  510  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  54.56 
 
 		 550 aa  503  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  51.67 
 
 		 552 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  49.6 
 
 		 522 aa  430  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0198  peptidase S49  38.65 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  39.06 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.88 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  38.02 
 
 		 332 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  37.57 
 
 		 329 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.3 
 
 		 584 aa  98.6  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  36.6 
 
 		 326 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.96 
 
 		 354 aa  97.4  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  36.6 
 
 		 326 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  33.73 
 
 		 325 aa  95.5  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.46 
 
 		 332 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  33.65 
 
 		 325 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  36.55 
 
 		 351 aa  91.3  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.55 
 
 		 351 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 329 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.86 
 
 		 282 aa  89.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2635  peptidase S49  31.15 
 
 		 328 aa  90.1  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.194824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 329 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.58 
 
 		 348 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.5 
 
 		 613 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  35.52 
 
 		 349 aa  89.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.18 
 
 		 326 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.39 
 
 		 324 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35 
 
 		 341 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.22 
 
 		 319 aa  87.8  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  28.43 
 
 		 301 aa  87.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  29.95 
 
 		 312 aa  87.4  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.73 
 
 		 342 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.31 
 
 		 323 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.97 
 
 		 357 aa  87  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.05 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.41 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.5 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.08 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  28.35 
 
 		 612 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  35.75 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.27 
 
 		 637 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.35 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.35 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  36.17 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.07 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.15 
 
 		 321 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.12 
 
 		 260 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  31.25 
 
 		 316 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  32.65 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.35 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.5 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.21 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  30.28 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.53 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.71 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  31.19 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.28 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.87 
 
 		 617 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  29.61 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  27.45 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  28.22 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.29 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  32.47 
 
 		 297 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  27.6 
 
 		 618 aa  80.1  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.35 
 
 		 329 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.25 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.14 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.14 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.63 
 
 		 621 aa  79.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.03 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.57 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.71 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.58 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  29.21 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  32.11 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.23 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.55 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  27.57 
 
 		 633 aa  78.2  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  30.2 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.95 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  31.79 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  35.23 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.62 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.94 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.91 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.15 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  25.94 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.62 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  31.86 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.53 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.73 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27 
 
 		 617 aa  77  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  32.2 
 
 		 378 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  27.65 
 
 		 316 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.75 
 
 		 336 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.18 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  29.03 
 
 		 269 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>